顕微鏡の発明は、14世紀にさかのぼることができます眼鏡のための研削レンズのイタリアの芸術。 この技術は、1590年にオランダのレンズグラインダー HansとZacharias Janssenによって取り上げられ、二つのレンズをチューブに入れて最初の顕微鏡を作りました。 1675年、Anton van Leeuwenhoekは血液を細かく見るためにレンズ一つだけの単純な顕微鏡を使用し、細胞を記述する最初の人になりました–体の周りに酸素を運ぶ赤血球。,

何世紀にもわたって、顕微鏡は免疫学的研究の発展に不可欠であったが、おそらく最も形成的な瞬間は1878年にプロイセン（現在のポーランド）のStrehlen（現Strzelin）の若手科学者Paul Ehrlichが博士論文で肥満細胞と呼ばれる血液の新しい成分の発見を記述したときに来た。 彼は、単に形質細胞であると考えられていたものの粒状の原形質は、アルカリ色素を添加することにより、顕微鏡下で見えるようにすることができ,

彼は、これらの粒状細胞が良好な栄養の兆候であると考えたので、彼はマストと呼ばれる動物肥育飼料のためのドイツ語の単語にちなんでそれら 実際、彼の顕微鏡の助けを借りて、Ehrlichは人間の免疫系に属する重要な細胞型、多くの最初のものを発見しました。 マスト細胞、そしてリリースヒスタミンおよびその他の物質中の炎症性、アレルギー反応です。,

Ehrlichの顕微鏡染料への関心は、組織を特異的に染色することができ、彼はリンパ球と白血球、白血球の二つの主要なグループを区別するための最初の人であることを導いた–免疫システムにおける重要なプレーヤー。 彼は、毒、特にリシン毒素に対してマウスを免疫する実験や、特定の疾患を標的とする特異的抗体に基づく”魔法の弾丸”のアイデアなど、免疫学におけるさらに多くの精髄的な発見を行った。, 彼の仕事は免疫学の彼の仕事の認識で1908年にノーベル賞をもたらし、彼の受け入れの講義で彼は生命の理解の顕微鏡の重要性を認めた。

しかし、不思議なことに、彼は顕微鏡の年齢がその天頂に達したと考えていました。 “顕微鏡が私たちのためにできたことの限界が近づいており、細胞生活の重要な、すべての支配的問題へのさらなる浸透のために、最も高度に洗練された光学援助でさえ、私たちには役に立たないと考える傾向があります”と彼は言いました。,

彼は、免疫蛍光などの標識や、電子顕微鏡や走査トンネル顕微鏡などの顕微鏡技術のさらなる進歩が、免疫系の複雑な仕組みにさらに光を当てることを知らなかった。