El Hospital St. Barnabas, originalmente conocido como el hogar de los Incurables, fue fundado en 1866 por el Reverendo Washington Rodman, de la Iglesia Episcopal Grace en West Farms, Bronx. El hospital se convirtió en el primer hospital de enfermedades crónicas y se alojó en una modesta casa marco y podía atender a 33 pacientes. El hospital se trasladó a su ubicación actual en la Tercera Avenida en 1874, donde en 1911 podía acomodar 300 camas., El apoyo para el hospital sin fines de lucro provino de la Sociedad de Nueva York, incluyendo a Cornelius Vanderbilt (quien sirvió en la Junta Directiva del hospital), John Jacob Astor, Theodore Roosevelt y Frederick Law Olmsted. Entre 1926 y 1931, el hospital añadió tres nuevos edificios al hospital y en 1947, el hospital cambió su nombre a St Barnabas Hospital. En 1969, St Barnabas comenzó la construcción de un ala oeste de seis pisos con 188 camas, una cafetería y cocina. El hogar de ancianos St Barnabas fue fundado en 1972 y está ubicado en el campus del hospital en 2175 Quarry Rd.

en 1983, el Dr., Ronald Gade fue ascendido a presidente del hospital desde jefe de radiología y trabajó para que el hospital fuera más eficiente en su atención a los pacientes. Redujo el tamaño del personal, desalentó largas estadías en el hospital y aumentó enormemente los ingresos de Medicaid debido a las mejoras. Sus implementaciones en St Barnabas desafiaron al establecimiento médico al crear una revolución de atención administrada en la medicina estadounidense. A finales de la década de 1990, el hospital ganó dos contratos de la ciudad por un valor de casi 4 450 millones, uno para proporcionar médicos para el Hospital Lincoln en el sur del Bronx, el otro para atender a los prisioneros en Rikers Island., En la década de 1990, el hospital recibió la designación estatal como Centro de Trauma de Nivel 2 y creó un centro de SIDA y un centro de accidentes cerebrovasculares.

el hospital es un importante sitio de enseñanza clínica para el Colegio de Medicina Osteopática de Nueva York. En 2016, el hospital también se convirtió en una filial de la escuela de Medicina de CUNY para reclutar a las minorías subrepresentadas en la medicina, aumentar la atención médica en las comunidades desatendidas y aumentar el número de médicos de atención primaria.