In der analytischen Chemie Serum sowie Plasma werden als Probenmaterial der Wahl empfohlen. Die Blutverarbeitung zur Erzeugung von Serum oder Plasma ist jedoch etwas anders., Ob Plasma oder Serum das bevorzugte Probenmaterial ist, wird noch kontrovers diskutiert. Wir führten in gepaarten Proben drei UHPLC-Massenspektrometrie-gesteuerte Metabolomik-Studien durch. In Studie 1 Metabolit-profile von serum vs plasma verglichen wurden. 46% von 216 identifizierten Metaboliten zeigten signifikante verschiedenen Ebenen (paired Wilcoxon signed-rank-test, p < 0.05, FDR <0,01) mit nur drei Metaboliten (Methionin, C2:0 – C3:0-Carnitin) zeigt den unteren Ebenen im serum., In Studie 2 ergab ein Vergleich von drei verschiedenen Serum – Blutentnahmeröhrchen, dass die Gerinnung und die damit verbundenen Prozesse die Metabolitenspiegel in Abhängigkeit vom röhrchenspezifischen Gerinnungsprozess deutlich verändern. Die ausgeprägtesten Unterschiede wurden für das Dipeptid Phenylalanin-Phenylalanin gefunden (höchste Konzentrationen in silikathaltigen Serumblutentnahmeschläuchen). In Studie 3 wurden mögliche Nebenwirkungen von Blutplättchen untersucht, die auch nach korrekter Verarbeitung noch im Standardplasma verbleiben., Beim Vergleich von Standard-und thrombozytenfreiem Plasma (PFP) wurden keine Unterschiede in einem Muster von 216 Metaboliten festgestellt. Unsere Ergebnisse geben neue Einblicke in grundlegende Unterschiede zwischen Serum und Plasma und liefern so wertvolle Informationen für analytische Chemiker zur Entscheidungsfindung, entweder Serum oder Plasma zu verwenden, bevor komplexe und zeitaufwändige analytische Untersuchungen beginnen.