Poveglia wurde gebaut auf einer permanenten Festung durch die venezianischen Regierung und von 1793-1814 verwendet wurde, als die Pest Quarantäne-station, oder „lazaretto“—eine von vielen in der venezianischen Lagune.
Auf der winzigen Insel sollen über 160.000 infizierte Seelen ihre letzten Tage und Stunden dort verbracht haben—so viele, dass es flüstert, dass 50 Prozent des Bodens aus menschlichen Überresten besteht., Kürzlich wurden auf den nahe gelegenen Inseln Lazaretto Nuovo und Lazzaretto Vecchio Massengräber mit den Überresten Tausender Pestopfer gefunden. Poveglia muss noch vollständig untersucht werden.
Als Napoleon den Ort Poveglia klein fand und leicht übersehen werden konnte, nutzte er die Insel auch für einen dunkleren Zweck und lagerte dort Waffen. Der Ort wurde entdeckt, und viele kleine Schlachten fanden statt, als die Insel noch mehr Leben forderte.
1922 wurde auf Poveglia eine psychiatrische Klinik eröffnet., Die lokale Legende besagt, dass ein Arzt im Krankenhaus viele seiner Patienten gefoltert und getötet und sie schrecklich abgeschlachtet hat, nur um später zu sterben, indem er von seinem Glockenturm gefallen ist oder möglicherweise von ihm abgeworfen wurde. Das Krankenhaus wurde 1968 geschlossen, und die Ruinen sind immer noch da und werden langsam vom Grün zurückerobert. Während es sich um ein ehemaliges Altersheim handelt, Beweise dafür, dass es psychische Patienten beherbergte, sind immer noch offensichtlich.
Bei einer solchen Vergangenheit ist es nicht verwunderlich, dass Poveglia als verfolgt gilt und die Aufmerksamkeit von Geisterjägern und paranormalen Ermittlern auf sich zieht.,
Anderswo in der Lagune sind die Überreste der Irrenanstalt auf der Insel San Servolo als Museum erhalten, das der Geschichte der Pestinseln und Asylheime Venedigs gewidmet ist.
Poveglia bleibt für Besucher vorerst strikt tabu.
Im Jahr 2014 berichtete die New York Daily News, dass Italien aufgrund einer schnell rückläufigen Wirtschaft die Insel und vier weitere erstklassige Immobilien zur Versteigerung stellte, was zu einem öffentlichen Aufschrei führte. Ab 2018 war das Schicksal der Insel noch in der Schwebe.