Einfluss auf die amerikanische Diplomatie
Marshall begann seine diplomatische Karriere als einer der drei Gesandten ernannt von Präsident Adams zu Verhandlungen mit dem französischen Außenminister Talleyrand im Jahre 1797. Die Mission scheiterte, was zur XYZ-Affäre und zum Quasi-Krieg mit Frankreich führte. Trotzdem verwandelten Marshalls Verhalten und seine Berichterstattung über den Skandal ein diplomatisches Versagen in einen persönlichen Triumph, als sein Ruf zu Hause stieg.,
Als Außenminister war Marshall weniger parteiisch und Präsident Adams gegenüber loyaler als Pickering. Adams vertraute Marshall beträchtliche Autorität über auswärtige Angelegenheiten an, insbesondere nachdem Adams die neu gegründete nationale Hauptstadt Washington für einen achtmonatigen Aufenthalt in Massachusetts verlassen hatte. Marshalls Ehrerbietung gegenüber Adams definierte die Position des Außenministers als politischen Untergebenen des Präsidenten und nicht als das unabhängige Amt, das Pickering sich vorgestellt hatte.,
Sekretär Marshall bekräftigte eine Politik der Nichtausrichtung in Bezug auf die europäischen Mächte in einer kritischen Zeit. Er teilte sich mit anderen Föderalisten wie Alexander Hamilton auf und unterstützte die laufenden Bemühungen, nach der demütigenden XYZ-Affäre mit Frankreich zu verhandeln. Er unterstützte die Konvention von 1800 zwischen den Vereinigten Staaten und Frankreich, die schließlich den nicht angemeldeten Seekrieg zwischen den beiden Ländern beendete. Im Umgang mit Großbritannien protestierte Marshall gegen die rechtswidrige Beschlagnahme der US-Schifffahrt durch die britische Marine und die Festnahme von U. S., seemann sowie die Toleranz der britischen Gerichte gegenüber Piraterie gegen US-Handelsschiffe. Marshall erkannte die Grenzen der US-Seemacht an und genehmigte widerwillig laufende Zahlungen an die barbarischen Piraten, die weiterhin US-Handelsschiffe überfielen. Er erlebte auch Frustration bei Verhandlungen mit den Spaniern, die die Neutralitätsrechte der USA missachteten und gegen die Unterstützung der USA für antikoloniale Aufstände im spanischen Amerika protestierten.