El a fondat Mouratoglou Academie de Tenis în 1996, în apropiere de Paris (mai târziu sa mutat la periferia orașului Nisa), și a antrenat multe up-și-vin jucători, inclusiv Marcos Baghdatis (pe care el a antrenat la finala din 2006 de la Australian Open), Julia Vakulenko, Anastasia Pavlyuchenkova, Aravane Rezaï, Jérémy Chardy, Laura Robson, Yanina Wickmayer și Grigor Dimitrov.

Mouratoglou a început coaching ATP player Marcos Baghdatis, în 1999, când Mouratoglou l-a invitat la el Academie de Tenis în octombrie 1999, într-o săptămână., Baghdatis a fost, potrivit lui Mouratoglou, „deloc sportiv”, însă în șapte ani va deveni numărul 1 mondial junior, va câștiga titlul de băieți Australian Open 2003, va ajunge în finala aceluiași turneu în 2006 și va ajunge în top zece din lume.în iulie 2007, a început să o antreneze pe Anastasia Pavlyuchenkova. În termen de doi ani, Pavlyuchenkova a ajuns în top 30 din lume și de atunci a făcut două sferturi de finală de Grand Slam și a ajuns la un clasament înalt al carierei numărul 13 Mondial. Au ajuns asocierea lor în August 2009, și Mouratoglou mutat pe coaching ambele Aravane Rezaï și Yanina Wickmayer., Rezaï s-a bucurat de un sezon de succes în 2010, intrând în top 20 mondial și câștigând evenimentul Premier de la Madrid, în timp ce Wickmayer a ajuns la un clasament al carierei de numărul 12 mondial în aprilie 2010. Mouratoglou oprit de lucru, cu atât Rezaï și Wickmayer în August 2010 și aprilie 2012, respectiv.în decembrie 2010, Mouratoglou a început să o antreneze pe Laura Robson, care era numărul 217 mondial la acea vreme și încă se chinuie să intre în turneul senior., Au lucrat împreună timp de șase luni înainte de a se separa cu puțin timp înainte de Wimbledon în 2011, când Robson încă se lupta să facă progrese în turneul WTA, după ce a alunecat mai departe la numărul 257 mondial. În aceeași perioadă, Mouratoglou l-a antrenat și pe Jérémy Chardy în cadrul academiei sale.

În Martie 2012, Mouratoglou a început coaching Grigor Dimitrov și a stabilit cu privire ghidare-l înapoi în lume, top 100, după ce a renunțat la Nr. 102 de când a început. Această asociere s-a încheiat în septembrie în acel an, iar Mouratoglou s-a mutat la actualul său loc de muncă, antrenând-o exclusiv pe Serena Williams.,

De timp Mouratoglou a început coaching Williams, ea a suferit doar o prima runda de deschidere a învinge în tabloul principal al unui turneu de Grand Slam, a pierdut în prima rundă din 2012 French Open. De atunci, Mouratoglou a ghidat Williams, a cincea, a șasea și a șaptea titluri Wimbledon, medalia de aur Olimpic, a patra, a cincea și a șasea US Open titluri, a doua și a treia franceză Deschide titluri, trei ani consecutiv-end campionatele titluri, a șasea și a șaptea de la Australian Open, titlul și a ridicat-o înapoi la Nr. 1 în lume în clasamentul WTA.,

În 2018, Stefanos Tsitsipas început de formare în academii de tenis, precum și ca fiind antrenată de Patrick Mouratoglou și tatăl lui Apostolos Tsitsipas.