Existem dois tipos principais do vírus da imunodeficiência humana. O HIV-1, que foi descoberto primeiro, é o tipo mais difundido em todo o mundo. O VIH-2 é mais de 55% geneticamente diferente do VIH-1.

HIV-2 é mais comum na África Ocidental e está se tornando mais comum na Índia, embora os números ainda são relativamente pequenos. Um pequeno número de casos também tem sido visto em Portugal, França, outros países europeus, incluindo o Reino Unido e as Américas, em grande parte em indivíduos de origem da África ocidental ou seus parceiros sexuais.,cada tipo principal de vírus pode ser subdividido em grupos, que podem ser subdivididos em clades ou subtipos. O HIV-1 compreende os grupos M (main), O (outlier) e N (non-M ou O). Existem dois subtipos principais do VIH-2, A E B.

devido à diferença genética, os antigénios do VIH-1 e do VIH-2 são suficientemente distintos para que, se um teste de diagnóstico for desenvolvido apenas para detectar o VIH-1, não detecte de forma fiável o VIH-2. No entanto, testes que são sensíveis a ambos os tipos de vírus estão disponíveis., É importante usar um teste que seja sensível ao HIV-2, especialmente quando se testa alguém que viveu em um país onde o HIV-2 é comum ou teve um parceiro sexual de um desses países. Além disso, se uma pessoa tiver sinais clínicos de infecção pelo VIH (por exemplo, infecções oportunistas recorrentes) mas não apresentar resultados positivos num teste que seja sensível apenas ao VIH-1, então seria apropriado efectuar testes específicos para o VIH-2.os medicamentos anti-VIH da classe dos inibidores não nucleósidos da transcriptase reversa (NNRTI) não são activos contra o VIH-2., This includes efavirenz, rilpivirine, doravirine, etravirine and nevirapine. Regimens based on an integrase inhibitor, or a protease inhibitor, are recommended.