hij richtte de Mouratoglou Tennis Academy op in 1996 nabij Parijs (later verplaatst naar de buitenwijken van Nice), en heeft vele opkomende spelers gecoacht, waaronder Marcos Baghdatis (die hij coachte naar de finale van het Australian Open 2006), Julia Vakulenko, Anastasia Pavlyuchenkova, Aravane Rezaï, Jérémy Chardy, Laura Robson, Yanina Wickmayer en Grigor Dimitrov.Mouratoglou begon met het coachen van de ATP-speler Marcos Baghdatis in 1999 toen Mouratoglou hem uitnodigde voor zijn Tennis Academy in oktober 1999., Baghdatis was, volgens Mouratoglou, “helemaal geen atleet”, maar binnen zeven jaar zou hij een junior wereld nummer 1 geworden, winnen de 2003 Australian Open boys’ titel, bereiken de finale van hetzelfde toernooi in 2006 en bereiken ‘ s werelds top tien.in juli 2007 begon hij met het coachen van Anastasia Pavlyuchenkova. Binnen twee jaar, Pavlyuchenkova bereikte de wereld top 30 en heeft sindsdien twee Grand Slam kwartfinales en bereikte een carrière-hoge ranking van de wereld No.13. In augustus 2009 beëindigde Mouratoglou de club en werd coach van Aravane Rezaï en Yanina Wickmayer., Rezaï genoot van een succesvol seizoen in 2010, waarin hij de top 20 van de wereld bereikte en het belangrijkste evenement in Madrid won, terwijl Wickmayer in April 2010 een carrière-hoge ranking van de wereld No. 12 bereikte. Mouratoglou stopte met werken voor zowel Rezaï als Wickmayer in augustus 2010 respectievelijk April 2012.in december 2010 begon Mouratoglou met het coachen van Laura Robson, die op dat moment nummer 217 was en nog steeds moeite had om in te breken in de senior tour., Ze werkten samen voor zes maanden voordat ze uit elkaar gingen kort voor Wimbledon in 2011, toen Robson nog steeds moeite had om vooruitgang te boeken op de WTA Tour, die verder was uitgegleden naar de wereld no.257. In dezelfde periode coachte Mouratoglou ook Jérémy Chardy binnen zijn Academie.in maart 2012 begon Mouratoglou met het coachen van Grigor Dimitrov en begon hem terug te leiden naar de top 100 van de wereld. Deze vereniging eindigde in September van dat jaar en Mouratoglou verhuisde naar zijn huidige baan, uitsluitend coaching Serena Williams.,tegen de tijd dat Mouratoglou begon met het coachen van Williams, had ze net haar eerste nederlaag in de eerste ronde van een Grand Slam-toernooi geleden, waarbij ze verloor in de eerste ronde van de 2012 French Open. Sindsdien, Mouratoglou heeft geleid Williams naar haar vijfde, zesde en zevende Wimbledon titels, de Olympische gouden medaille, haar vierde, vijfde, en zesde US Open titels, haar tweede en derde Franse Open titels, drie opeenvolgende jaar-end titels, haar zesde en zevende Australian Open titel en tilde haar terug naar de wereld No.1 in de WTA rankings.,in 2018 begon Stefanos Tsitsipas te trainen in zijn tennisacademies en werd hij gecoacht door Patrick Mouratoglou en zijn vader Apostolos Tsitsipas.