oncologische Letters

Inleiding

nasofaryngeaal carcinoom (NPC) is een van de meest voorkomende maligniteiten in het hoofd en de nek (1). NPC heeft een unieke geografische distributie en komt voor in Zuidoost-Azië, het Midden-Oosten en Noord-Afrika (1). In endemicareas kan de NPC-incidentie oplopen tot 35 gevallen per 100.000 personen onder mannen van middelbare leeftijd (2)., De 5-jaarsoverleving van patiënten met NPC in een vroeg stadium is tot 95%,maar het overlevingspercentage van patiënten met NPC in een gevorderd stadium is slechts ~60% (3,4) en 70% van de nieuw gediagnosticeerde patiënten met NPC heeft een locoregionaal gevorderde ziekte (5). Daarom is het onderzoeken van potentiële biomarkers voor de identificatie van patiënten met NPC ‘ s in een vroeg stadium belangrijk om de patiëntresultaten te verbeteren.

de aanwezigheid van Epstein-Barr virus (EBV) DNA INPLASMA wordt momenteel gebruikt voor het screenen van asymptomatische patiënten met NPC, maar de positieve voorspellende waarde voor tumorscreening is relatief laag (11%) (6).,Bovendien wijst accumulerend bewijsmateriaal erop dat polygenen en celwegen, met inbegrip van de transformerende groeifactor-β signaalweg en Notch signaalweg, kunnen bijdragen tot de ontwikkeling en progressie van NPC (7-9).

De precieze moleculaire mechanismen die aan deprogressie van NPC ten grondslag liggen, blijven onduidelijk en de vroegtijdige diagnose en behandeling van NPC is momenteel beperkt (10,11).Daarom zijn verdere studies nodig om de moleculaire mechanismendie betrokken zijn bij NPC-proliferatie en-progressie, op te helderen voor een alomvattend begrip van NPC-carcinogenese.,

Genmicroarrays, die hoogdoorputplatvormen zijn voor de analyse van genexpressie, maken de identificatie mogelijk van honderden differentieel tot expressie gebrachte genen (degs)die betrokken zijn bij verschillende signaalwegen, moleculaire functies en biologische processen (12-14). Er werden echter slechts beperkte overlappingen waargenomen bij vergelijkende analyse van de DEGs in onafhankelijke onderzoeken (15,16). Het combineren van microarray technologieën en bioinformatiehulpmiddelen verbetert de efficiency en nauwkeurigheid van analyse (15,16)., Wang et al (15) en Jiang et al (16) analyseerden de gse12452-dataset, die 31 NPC-monsters en 10 normale controlemonsters bevatte, om de sleutelgenen te identificeren die betrokken zijn bij NPC. Echter, het aantal samplesincluded in deze twee studies was relatief klein, en themolecular trajecten betrokken bij NPC carcinogenese blijven onduidelijk.In de huidige studie, de GSE12452 (17), GSE34573 (18) en GSE64634 (19) datasets werden gedownload van de GeneExpression Omnibus-database (GEO; www.ncbi.nlm.nih.gov/geo; GPL570 Affymetrix Menselijk Genoom U133 Plus 2.0 Array) te identificeren Gr inNPC weefsels., Vervolgens, gene ontologie (GO; www.geneontology.org) en de analyse van de wegverrijking werden uitgevoerd om de biologische functies en wegen van sleutelgenen te identificeren (20). De resultaten van de huidige studie bieden nieuwe inzichten in potentiële biomarkers voorpc en kunnen bijdragen tot het huidige begrip van de moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan NPC-proliferatie en-progressie.

materialen en methoden

microarray gegevens

drie genexpressieprofielen (GSE12452, GSE34573 en GSE64634) werden gedownload van de GEO-database., GSE12452, die gebaseerd was op het Affymetrix gpl570 platform , werd ingediend door Ahlquist et al (17). De gse12452-dataset bevatte 31 NPC-monsters en 10 normale NPC-monsters. De analyse voor differentialgene expressie tussen tumor en normaal weefsel werd uitgevoerd met behulp van genespring software Versie 11.5 (Agilent Technologies, Inc., SantaClara, CA, USA). Gse34573, ingediend door Hu et al (18), was gebaseerd op het Affymetrix GPL570platform en bestond uit 16 NPC-monsters en 3 normale controlemonsters., GSE64634, ingediend door Xiong et al, was gebaseerd op het Affymetrix gpl570-platform en bestond uit 12 NPC-monsters en 4 normale controles (19). De t-test van AStudent werd gebruikt om DEGs te identificeren met een verandering van≥2-voudig. P<0,05 werd geacht een statistisch significant verschil aan te geven.

GO en pathway enrichment analysis ofDEGs

Go analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes andGenomes (KEGG; www.genome.jp/kegg/pathway.html) pathway-analyse werd uitgevoerd om DEGs op biologisch functioneel niveau te identificeren(21)., De Database voor annotatie, visualisatie en geïntegreerde ontdekking (DAVID; david.abcc.ncifcrf.gov) werd gebruikt aan integratefunctionele genomic annotaties (22). P<0,05 werd beschouwd als een statistisch significant verschil (23).

integratie van het PPI-netwerk (protein-proteininteractie)

Het zoekinstrument voor het ophalen van InteractingGenes versie 10.0 (STRING; string-db.org) werd gebruikt voor de verkenning van potentiële DEG-interacties op het eiwitniveau (24). De PPI-netwerken van Degs door Stringwerden afgeleid van gevalideerde experimenten (25)., Een PPI-score van >0,4 werd als significant beschouwd. De PPI-netwerken werden gevisualiseerd met behulp van Cytoscapesoftware (http://www.cytoscape.org) (26). P<0,05 werd beschouwd als een statistisch significant verschil.

resultaten

Identificatie van DEGs

NPC en normale monsters (respectievelijk 59 en 17)werden eerst geanalyseerd. De software van GeneSpring werd gebruikt om de series van elke chip te analyseren en de DEGs te identificeren., Na analyse van gse12452, GSE34573, gse64634 datasets, 1.301 (553 upregulated and748 downregulated), 1.232 (348 upregulated and 884 downregulated)en 1.218 (555 upregulated and 663 downregulated) genen werden geïdentificeerd, respectievelijk. De resultaten van de clusteranalyse vandegs onthulden significante verschillen tussen de normalnasopharyngeal weefsel en NPC monsters (Fig. 1). Met behulp van Venn diagramanalyse werden 268graden(59 opregulated en 209 downregulated) op het snijpunt van de bovengenoemde drie datasets geselecteerd voor verdere analyse (Fig. 2).,

Go term enrichment analysis

de geïdentificeerde DEGs werden geüpload naar de onlinesoftware DAVID voor GO-en KEGG-pathway-analyses. Uit de resultaten van de go-analyse bleek dat opregulerende DEGs aanzienlijk werden verbeterd in biologische processen, waaronder ‘celadhesie’, ‘celdivisie’, ‘mitose’ en ‘mitotische celcyclus’ (tabel i; Fig.3A). De downregulated DEGs werden voornamelijk verrijkt in ‘microtubule – based movement’, ‘cilium movement’, ‘cilium axonemeassembly’ en ‘epitheliale celdifferentiatie’ (tabel i; Fig.3B)., In termen van moleculaire functie werden de opgereguleerde DEGs verrijkt in ‘phosphatidylinositol-gemedieerde signalering’ en werden de gedownreguleerde DEGs verrijkt in ‘axonemal dynein complexassembly’ (tabel I).

tabel I.

nasofaryngealcarcinoom.,

Kegg-pathway-analyse

Kegg-pathway-analyse toonde aan dat de opgehoopte degradaties sterk geassocieerd waren met pathways, waaronder ‘ECM-receptorinteractie’, ‘humaan papillomavirus-infectie’, ‘aritmogenicright ventriculaire cardiomyopathie’ en “focale hechting” (tabel II; fig.4A). De gedegreguleerde DEGs werden verrijkt in “metabolicpathways”, “Huntington’ s disease”, “fluid shear stress”, “atherosclerose” en “chemical carcinogenesis” (tabel II; Fig.4B).,

Table II.

degs geassocieerd met nasofaryngealcarcinoom.

PPI-netwerk

De DEG-expressieprofielen in NPC werden geconstrueerd volgens de informatie in de STRINGDATABASE. Na de verwijdering van geïsoleerde en gedeeltelijk verbonden knooppunten, werd een netwerk van graden geconstrueerd (Fig. 5)., Thetop 10 hub genen, de genen, het tentoonstellen van de mostsignificant interactie, opgenomen dynein axonemal lightintermediate keten 1 (DNALI1), dynein axonemal ketting 2(DNAI2), calmodulin 1 (CALM1), coiled coil domein met 114(CCDC114), dynein axonemal zware keten 5 (DNAH5), radiale sprak head9 homologe (RSPH9), radiale sprak hoofd onderdeel 4A (RSPH4A), NDC80kinetochore complexe component (NDC80), thymidylate synthetase(TYMS) en coiled coil domein bevat 39 (CCDC39). Dnali heeft de hoogste knooppuntgraad van 18 aangetoond.,

discussie

NPC is een van de meest voorkomende plaveiselceltumoren in het hoofd-halsgebied (1). Het overlevingspercentage na 5 jaar onder patiënten met stadium I van de ziekte is 95% (3). Het overlevingspercentage van 5 jaar onder patiënten met stadium IV ziekte is echter iets meer dan 60% (27). Daarom is inzicht in theetiologische factoren en moleculaire mechanismen van NPC progressie essentieel voor diagnose en behandeling. De Microarray technologie is wijd toegepast om de potentiële therapeutische doelstellingen voor carcinoom, met inbegrip van colorectal kanker (12-14) te voorspellen.,Eerder analyseerden Wang et al (15)de dataset van GSE12452 en onthulden dat cyclin B1, mitoticarrest deficiënte 2 als 1, prolifererende cel nucleair antigeen,mucine 1, celoppervlakte geassocieerd en aldehyde dehydrogenase 1familielid A1 in EBV-geassocieerd NPC kan worden betrokken (15). Een studie die gse12452 gegevens analyseert suggereerde dat C-X-C motief chemokine ligand (CXCL) 9, ZIC familymember 2, prostaglandine-endoperoxide synthase 2, fibronectin 1,CXCL10 en ovo zoals transcriptional repressor 1 Rollen inNPC (16) kunnen dienen., Het aantal steekproeven uit individuele datasets was echter relatief klein (15,16). In de huidige studie werden 3 datasets geanalyseerd en werden 53 upregulated en 209 downregulated DEGs gescreend door bioinformaticaanalyse.,

De resultaten van de KEGG pad verrijking analysisand GA functie annotatie bleek dat up gereguleerd Gr weremainly verrijkt in de ‘cel adhesie’, ‘celdeling’, ‘mitose,”mitotische cyclus’, ‘ECM-receptor interactie’ en ‘humanpapillomavirus infectie’, terwijl downregulated Gr waren mainlyinvolved in ‘axonemal dynein complexe montage’, ‘microtubule-basedmovement’, ‘metabole pathways’, ‘Huntington’ s disease’, ‘fluidshear stress’ en ‘atherosclerose’ en ‘chemische carcinogenese’.,Eerdere studies hebben aangetoond dat upregulation ordownregulation van specifieke genen NPC cel invasie,metastase, proliferatie en apoptose kan beïnvloeden (28-30).Dit resultaat is consistent met het feit dat carcinoom cellinvasion en metastase nauw geassocieerd zijn met abnormale celladhesievorming en celdeling (28-30).Voorts zijn de proliferatie van de kankercel en apoptosis nauw verbonden met abnormaliteiten in de mitotic celcyclus (28-30)., Een vorige studie toonde aan dat colorectale kankercellen interageren metstromale cellen door ECM-componenten te produceren, direct celcontact te bemiddelen en groeifactoren af te scheiden (31). Bovendien heeft bestaand bewijsmateriaal aangetoond dat de modificatie van cellulair DNA en histonen wordt veroorzaakt door tussenproducten van cellulaire metabole routes (32). Daarom kan de analyse van de betrokken signaleringspadways nieuwe inzichten verschaffen voor het begrijpen van de verspreiding van kankercellen.

in deze studie werd een PPI-netwerk opgezet om de 10 belangrijkste hub-genen te identificeren., Deze waren als volgt: DNALI1, DNAI2, CALM1, CCDC114, DNAH5, RSPH9,RSPH4A, NDC80, TYMS en CCDC39. DNALI1 was het hubgen die de hoogste graad van connectiviteit tentoonstellen. Peng et al (33) toonden aan dat de mRNA-spiegels van Dnali1 significant waren verlaagd bij patiënten met allergisch neusslijmvlies vergeleken met de controlegroep (P<0,05). Parris et al (34) rapporteerden dat verscheidene kwaadaardige tumors met normale gendoseringsniveaus dnali1 downregulation toonden,die suggereren dat DNALI1 een nieuw therapeutisch doel voor kankerdrugsontwikkeling kan zijn., Het tweede geà dentificeerde hub-gen, DNAI2, dat ook eiwitcodeert, wordt geassocieerd met primaire ciliarydyskinesie (PCD) (35). DNAI2 en forkhead box J1 zijn ciliated cell markers (36). Het derde hub-gen, CALM1, is een van de genen die codeert voor het calmoduline-eiwit (37). Kim et al (38) voerden grootschalige genoomanalyses uit voor borstkanker en de resultaten toonden aan dat CALM1, als potentiële regulator van eiwitkinase B, sterk tot expressie kwam in fosfatidylinositol-4,5-bisfosfaat 3-kinase katalytische subunita gemuteerde borstkanker., Bovendien werden calciumbindende proteïnescalm1, calumenine en reticulocalbine 1, aanzienlijk gereguleerd in doorstraalde tumorcellen, die aan hypoxie werden onderworpen, wat erop wijst dat deze mediatoren een belangrijke rol spelen bij het bevorderen van de overleving van tumorcellen tijdens hypoxie (39). Vergelijkbaar met DNAI2, ccdc114 is een van de PCD-geassocieerde genen, waarbij verlies-van-functie mutatiesresult in PCD met lateraliteitsmisvormingen met hartafwijkingen(40). De afwezigheid of mislokalisatie van een ander hub-gen, DNAH5, is een karakteristiek kenmerk voor beweeglijke ciliaire abnormaliteit in neuspoliepen (41)., De overige vijf hub-genen in de huidige studie waren RSPH9, RSPH4A, NDC80, TYMS en CCDC39. Yoonet al (42) meldde dat theRSPH9 methylatiepatroon een prognostische indicator is bij patiënten met niet-spier invasieve blaaskanker. RSPH9 en RSPH4A zijn radialspoke head eiwitgenen, waarbij mutaties primaire ciliarydyskinesie met centrale-microtubulaire-paar afwijkingen veroorzaken (43). TYMS is een sleutelenzym in de denovo-synthese van 2′-deoxythymidine-5′-monofosfaat van 2′-deoxyuridine-5′ – monofosfaat (44)., CCDC39 en CCDC40 werden voor het eerst als causatieve mutaties vastgesteld bij patiënten met primaire ciliarydyskinesie en zijn waarschijnlijk betrokken bij de rekrutering van tubulineglutamylase(s) tot de flagella (45), waarvan niet is vastgesteld dat ze verband houden met de ontwikkeling van NPC.

concluderend werd in deze studie een uitgebreide bioinformaticaanalyse uitgevoerd van DEGs die betrokken kan zijn bij NPC-progressie. De resultaten kunnen nieuwe inzichten opleveren voor doelen die kunnen worden gebruikt voor het toekomstige onderzoek naar moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan NPC., De specifieke functies van de geïdentificeerde genen in NPC moeten echter door verdere moleculair-biologische experimenten worden bevestigd.

bevestigingen

niet van toepassing.

financiering

Er is geen financiering ontvangen.

beschikbaarheid van gegevens en materialen

De datasets die tijdens dit onderzoek zijn gebruikt, zijn op redelijk verzoek verkrijgbaar bij de corresponderende auteur.

bijdragen van auteurs

HMZ en QF hebben de studie ontworpen en ontworpen. HMZ, QF, LXQ, BLL, LY en XH voerden de bioinformatica analyse uit. LXQand BLL heeft de gegevens geanalyseerd. HMZ en QF schreven het manuscript., Ly andXH bekeek en controleerde het manuscript. Alle auteurs hebben het laatste manuscript gelezen en goedgekeurd.

ethische goedkeuring en toestemming om deel te nemen

niet van toepassing.

toestemming van de patiënt voor publicatie

niet van toepassing.

concurrerende belangen

De auteurs verklaren geen concurrerende belangen te hebben.,ochore complexcomponent

TYMS

thymidylate synthetase

CCDC39

coiled-coil domain containing 39

PCD

primary ciliary dyskinesia

Chua MLK, Wee JTS, Hui EP and Chan ATC:Nasopharyngeal carcinoma., Lancet. 387:1012–1024. 2016. Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Li K, Lin GZ, Shen JC and Zhou Q: Timetrends of nasopharyngeal carcinoma in urban Guangzhou over A12-year period (2000-2011): dalingen in both incidence andmortality. Aziatische Pac J Kanker Vorige. 15:9899–9903. 2014., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Lee AW, Sze WM, Au JS, Leung SF, Leung TW,Chua DT, Zee BC, Law SC, Teo PM, Tung sy, et al: Treatment results for nasopharyngeal carcinoma in de moderne tijd: de Hong Kongexperience. Int J Radiat Oncol Biol Phys. 61:1107–1116. 2005.,Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Jing L, Zou X, Wu YL, Guo JC, Yun JP, XuM, Feng QS, Chen LZ, Bei JX, Zeng YX and Chen MY: A comparison between the Sixth and seventh editions of the UICC/AJCC Stagesysteem voor nasofaryngeaal carcinoom in een Chinese cohort. PLoS ÉÉN.9: e1162612014., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Pan JJ, Ng WT, Zong JF, Lee SW, Choi HC,Chan LL, Lin SJ, Guo QJ, Sze HC, Chen YB, et al: Prognosticnomogram for refining the prognostication of the voorgesteld 8dedition van het AJCC/UICC staging System voor nasofaryngeale kankerin het tijdperk van intensiteit-gemoduleerde radiotherapie. Kanker.122:3307–3315. 2016., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Chan KCA, WOO JKS, King A, Zee BCY, LamWKJ, Chan SL, Chu SWI, Mak C, Tse IOL, Leung SYM, et al: analyse van plasma Epstein-Barr virus DNA to screen voor Nasofaryngealcancer. Nieuw Engl J Med. 377:513–522. 2017. Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Tulalamba W and Janvilisri T:Nasopharyngeal carcinoma signaling pathway: An update on molecularbiomarkers. Int J Cell Biol., 2012:5946812012. Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Huang G, Du MY, Zhu H, Zhang N, Lu ZW,Qian LX, Zhang W, Tian X, He X and Yin L: MiRNA-34a reversedTGF-β-induced epithelial-mesenchymale overgang via onderdrukking van SMAD4 in NPC cellen. Biomed Pharmacother. 106:217–224. 2018.,Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Zhu HM, Jiang XS, Li HZ, Qian LX, Du MY,Lu ZW, Wu J, Tian XK, Fei Q, He X en Yin L: miR-184 remt tumorinvasion, migratie en metastase bij nasofaryngeaal carcinoom door targeting notch2. Celfysiol Biochem. 49:1564–1576. 2018.,Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Coghill AE, Hsu WL, Pfeiffer RM, Juwana H,Yu KJ, Lou PJ, Wang CP, Chen JY, Chen CJ, Middeldorp JM andHildesheim a: Epstein-Barr virus serologie als een potentiële screeningmarker voor nasofaryngeale carcinoom onder hoog-risico individuënvan multiplexfamilies in Taiwan. Kanker Epidemiol BiomarkersPrev. 23:1213–1219. 2014., Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Ng WT, Yau TK, Yung RW, Sze WM, Tsang AH,Law AL and Lee AW: Screening for family members of patients withnasopharyngeal carcinoma. Int J Kanker. 113:998–1001. 2005.Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Kulasingam V and Diamandis EP: strategies for discovering novel cancer biomarkers through utilization of emerging technologies. Nat Clin Pract Oncol. 5:588–599. 2008.,View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Nannini M, Pantaleo MA, Maleddu A, AstolfiA, Formica S and Biasco G: Gene expression profiling in colorectalcancer using microarray technologies: Results and perspectives.Cancer Treat Rev. 35:201–209. 2009. View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Bustin SA and Dorudi S: Gene expressionprofiling for molecular staging and prognosis prediction incolorectal cancer., Expert Rev Mol Diagn. 4:599–607. 2004.Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Wang J, Mei F, Gao X and Wang S:Identification of genes involved in Epstein-Barr virus-associatednasopharyngeal carcinoma. Oncol Lett. 12:2375–2380. 2016.Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Jiang X, Feng L, Dai B, Li L and Lu W:Identification of key genes involved in nasopharyngeal carcinoma.Braz J Otorhinolaryngol. 83:670–676. 2017., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Sengupta S, den Boon ja, Chen IH, NewtonMA, Dahl DB, Chen M, Cheng YJ, Westra WH, Chen CJ, Hildesheim A, etal: Genome-wide expression profiling reveals EBV-Geassocieerde remming van MHC klasse I expressie bij nasofaryngeaal carcinoom.Cancer Res. 66: 7999-8006. 2006., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Hu C, Wei W, Chen X, Woodman CB, Yao Y,Nicholls JM, Joab I, Sihota SK, Shao JY, Derkaoui KD, et al: Aglobal view of the oncogenic landscape in nasofaryngeaal carcinoom:een geïntegreerde analyse op de genetische en expressie niveaus. PLoSOne. 7: e410552012., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Bo h, Gong Z, Zhang W, Li X, Zeng Y, LiaoQ, Chen P, Shi l, Lian Y, Jing Y, et al: Upregulated longnon-coding RNA AFAP1-AS1 expression is associated with progressieen slechte prognose van nasofaryngeaal carcinoom. Oncotdoel.6:20404–20418. 2015., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Tweedie s, Ashburner M, Falls K, LeylandP, McQuilton P, Marygold S, Millburn G, Osumi-Sutherland D,Schroeder A, Seal R, et al: FlyBase: Enhancing Drosophila geneontologie annotaties. Nucleic Acids Res.37:(Database Issue).D555-D559. 2009. Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Kanehisa M and Goto S: Kegg: Kyotoencyclopedia of genes and genomes. Nucleic Acids Res. 28: 27-30.2000., Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Dennis G Jr, Sherman BT, Hosack DA, YangJ, Gao W, Lane HC and Lempicki RA: DAVID: Database for annotation,visualization, and integrated discovery. Genome Biol. 4: P32003.Bekijk artikel: Google Scholar:PubMed/NCBI

Huang da W, Sherman BT and Lempicki RA: Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVIDbioinformatics resources. Nat Protoco. 4:44–57. 2009., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Szklarczyk D, Franceschini A, Wyder s,Forslund K, Heller D, Huerta-Cepas J, Simonovic M, Roth A, SantosA, Tsafou KP, et al: STRING v10: Protein-eiwit Interactienetwerken, geïntegreerd over de boom van het leven. Nucleic Acids Res.43:(Database Issue). D447-D452. 2015., Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Franceschini A, Szklarczyk D, Frankild s,Kuhn M, Simonovic M, Roth A, Lin J, Minguez P, Bork P, von Mering cand Jensen LJ: STRING v9. 1: eiwit-eiwitinteractienetwerken, met verhoogde dekking en integratie. Nucleic Acids Res.41:(Database Issue). D808–D815. 2013., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Shannon P, Markiel a, Ozier O, Baliga NS,Wang JT, Ramage D, Amin N, Schwikowski B and Ideker T: Cytoscape: Asoftware environment for integrated models of biomolecularinteraction netwerken. Genome Res. 13: 2498-2504. 2003., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Li J, Zou X, Wu YL, Guo JC, Yun JP, Xu M,Feng QS, Chen LZ, Bei JX, Zeng YX and Chen MY: A Comparison between the Sixth and Seventh Editions of the UICC/AJCC staging System Fornasopharyngeaal carcinoom in een Chinese cohort. PLoS ÉÉN.9: e1162612014., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Qi XK, Han HQ, Zhang HJ, Xu M, Li l, ChenL, Xiang T, Feng QS, Kang T, Qian CN, et al: ovol2 links stemnessand metastase via fine-tuning epitheliaal-mesenchymale overgang INNASOFARYNGEAAL carcinoom. Theranostics. 8:2202–2216. 2018.,Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Gao Q, Tang L, Wu l, Li K, Wang H, Li W,Wu J, Li m, Wang S en Zhao L: LASP1 bevordert de progressie van nasopharyngealcarcinoom door negatieve regulatie van de tumorsuppressor PTEN. Celdood Dis. 9:3932018., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Ren X, Yang X, Cheng B, Chen X, Zhang T,He Q, Li B, Li Y, Tang X, Wen X, et al: HOPX hypermethylation bevordert metastase via activerende SLAKKENTRANSCRIPTIE innasofaryngeaal carcinoom. Nat Commun. 8:140532017., View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Vicente CM, Ricci R, Nader HB and Toma L:Syndecan-2 is upregulated in colorectal cancer cells throughinteractions with extracellular matrix produced by stromalfibroblasts. BMC Cell Biol. 14:252013. View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Schvartzman JM, Thompson CB and FinleyLWS: Metabolic regulation of chromatin modifications and geneexpression. J Cell Biol. 217:2247–2259. 2018., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Peng Y, Chen Z, Guan WJ, Zhu Z, Tan KS,Hong H, Zi X, Zeng J, Li Y, Ong YK, et al: Downregulation andaberrant localization of Forkhead Box J1 in allergische neus mucosa.Int Arch Allergy Immunol. 176:115–123. 2018., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Parris TZ, Danielsson A, Nemes S, KovácsA, Delle u, Fallenius G, Möllerström E, Karlsson P and Helou K:Clinical implications of gene dosering and gene expression patternsin diploid breast carcinoom. Clin Cancer Res. 16: 3860-3874. 2010.,Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Fedick AM, Jalas C, Treff NR, Knowles MRand Zariwala MA: Dragerfrequenties van elf mutaties in achtgenen geassocieerd met primaire ciliaire dyskinesie in de AshkenaziJewish populatie. Mol Genet Genomic Med. 3:137–142. 2015.,Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Milara J, Armengot M, Bañuls P, Tenor h,Beume R, Artigues E en Cortijo J: Roflumilast N-oxide, to PDE4inhibitor, improves cilia motility and geciliateerde menselijke Bronchialepitheliale cellen aangetast door sigarettenrook in vitro. Br JPharmacol. 166:2243–2262. 2012., Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Weile J, Sun s, Cote AG, Knapp J, Verby M,Mellor JC, Wu Y, Pons C, Wong C, Van Lieshout N, et al: A frameworkfor exhaustively mapping functional missense variants. Mol SystBiol. 13:9572017., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Kim JY, Lee E, Park K, Park WY, Jung HH,Ahn JS, Im YH and Park YH: Clinical implications of genomicprofiles in metastatic breast cancer with a focus on TP53 andPIK3CA, de meest gemuteerde genen. Oncotdoel.8:27997–28007. 2017.,PubMed/NCBI

Ren Y, Yeoh KW, Hao P, Kon OL en Sze SK:bestraling van epitheliale carcinoomcellen upregulatescalciumbindende eiwitten die overleving onder hypoxicomstandigheden bevorderen. J Proteome Res. 15: 4258-4264. 2016., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Onoufriadis A, Paff T, Antony D, ShoemarkA, Micha D, Kuyt B, Schmidts M, Petridi S, Dankert-Roelse JE,Haarman EG, et al: Splice-site mutations in the axonemal Outerdynein arm docking complex gen ccdc114 oorzaak primaire ciliarydyskinesia. Am J Hum Genet. 92:88–98. 2013., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Qiu Q, Peng Y, Zhu Z, Chen Z, Zhang C, OngHH, Tan KS, Hong H, Yan Y, Huang H, et al: Absence ormislocalization of DNAH5 is a characteristic marker for motileciliary afwijking in neuspoliepen. Laryngoscoop. 128: E97–E104.2018., Bekijk artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Yoon HY, Kim YJ, Kim JS, Kim YW, Kang HW,Kim WT, Yun SJ, Ryu KH, Lee SC and Kim WJ: rsph9 methylationpatroon as a prognostisch indicator bij patiënten met niet-Muscleinvasieve blaaskanker. Oncol Rapport 35: 1195-1203. 2016., Bekijk Artikel : Google Scholar : PubMed/NCBI

Castleman VH, Romio L, Chodhari R, HirstRA, de Castro SC, Parker KA, Ybot-Gonzalez P, Emes RD, Wilson SW,Wallis C, et al: Mutaties in radiale sprak hoofd eiwit genen RSPH9and RSPH4A oorzaak primaire ciliaire dyskinesie withcentral-microtubular-paar afwijkingen. Am J Hum Genet.84:197–209. 2009., Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Wang X, Guan Z, Dong Y, Zhu Z, Wang J andNiu B: Inhibition of thymidylate synthase affects neural tubedevelopment in mice. Reprod Toxicol. 76:17–25. 2018. Bekijk artikel: Google Scholar: PubMed/NCBI

Lin H, Zhang Z, Guo s, Chen F, Kessler JM,Wang YM en Dutcher SK: een Nima-gerelateerd kinase onderdrukt de flagellaire instabiliteit geassocieerd met het verlies van meerdere axonemalstructuren., PLoS Genet. 11:e10055082015. View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Geef een reactie

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd. Vereiste velden zijn gemarkeerd met *