In mei 1940 vielen de Duitsers Nederland binnen. Een van hun beperkingen was het verbod op de jeugdclub. In mei 1942 kwam een goed geklede vrouw met een koffer in de hand naar de tien Booms en vertelde hen dat ze Joods was, dat haar man een paar maanden eerder was gearresteerd, dat haar zoon was ondergedoken en dat de bezettingsautoriteiten haar onlangs hadden bezocht, zodat ze bang was om terug te gaan. Ze hoorde dat de tien Booms eerder hun Joodse buren, de Weils, hadden geholpen en vroeg of zij haar ook konden helpen., Casper was het er gemakkelijk mee eens dat ze bij hen kon blijven, hoewel het hoofdkwartier van de politie slechts een half blok verderop was. Als toegewijde lezer van het Oude Testament geloofde hij dat de Joden het “uitverkoren volk” waren en zei tegen de vrouw: “in dit huishouden zijn Gods mensen altijd welkom.”Het gezin werd toen zeer actief in de Nederlandse underground, verborg vluchtelingen en eerde de Joodse Sabbat. De familie heeft nooit geprobeerd om een van de Joden die bij hen bleef bekeren.,Corrie en haar zus Betsie openden hun huis voor Joodse vluchtelingen en leden van het verzet, en als gevolg daarvan werden ze gezocht door de Gestapo en haar Nederlandse tegenhanger. Het VluchtelingenWerk van Ten Boom en haar zus in het Beje werd bekend door het Nederlandse verzet, dat een architect naar het Huis van Ten Boom stuurde om een geheime kamer naast de kamer voor de ondergedoken Joden te bouwen en een waarschuwingszoemer die gebruikt kon worden om de vluchtelingen te waarschuwen zo snel mogelijk de kamer in te komen., Zo creëerden de tien barrières “de schuilplaats “(de Schuilplaats of de Béjé, uitgesproken als” bayay”, een afkorting van de straat, Barteljorisstraat). De geheime kamer was in Corrie ‘ s slaapkamer achter een valse muur en zou 6 personen bevatten. Voor de inzittenden werd een ventilatiesysteem geïnstalleerd. Een zoemer was te horen in het huis om de vluchtelingen te waarschuwen om zo snel mogelijk in de kamer te komen tijdens veiligheidscontroles door de buurt. Ze hadden ruimte genoeg, maar door oorlogstekorten was voedsel schaars., Iedere niet-Joodse Nederlander had een rantsoenkaart gekregen, de vereiste voor het verkrijgen van wekelijkse voedselbonnen. Door haar liefdadigheidswerk kende Ten Boom veel mensen in Haarlem en herinnerde zich een gezin met een gehandicapte dochter, wiens vader een ambtenaar was die nu de leiding had over het lokale rantsoen-kaartkantoor. Ze ging naar zijn huis op een avond, en toen hij vroeg hoeveel rantsoen kaarten ze nodig had, “ik opende mijn mond om te zeggen, ‘vijf,'” tien Boom schreef in de schuilplaats. “Maar het aantal dat onverwacht en verbazingwekkend uitkwam in plaats daarvan was:’ honderd.,”Hij gaf ze aan haar en ze gaf kaarten aan elke Jood die ze ontmoette.ten Boom ‘ s betrokkenheid bij het Nederlandse verzet groeide verder dan het verzamelen van gestolen rantsoenkaarten en het huisvesten van Joden in haar huis. Ze werd al snel onderdeel van het Nederlandse ondergrondse verzetsnetwerk en hield toezicht op een netwerk van het smokkelen van Joden naar veilige plaatsen. Al met al werden naar schatting 800 Joden gered door Ten Boom ‘ s inspanningen.op 28 februari 1944 vertelde een Nederlandse informant, Jan Vogel, de nazi’ s over het werk van de Ten Booms, rond 12.30 uur., van die dag arresteerden de nazi ‘ s de hele familie Ten Boom. Ze werden naar de Scheveningse gevangenis gestuurd toen Verzetsmaterialen en extra rantsoenkaarten in het huis werden gevonden. Nollie en Willem werden onmiddellijk vrijgelaten, samen met Corrie ‘ s neef Peter Van Woerden; Casper overleed tien dagen later. De groep van zes mensen verborgen door de tien barrières, bestaande uit zowel Joden als verzetswerkers, bleef onontdekt. Hoewel het huis na de arrestatie van Ten Boom constant in de gaten werd gehouden, coördineerden politieagenten die ook lid waren van de verzetsgroep de ontsnapping van de vluchtelingen., Ten Boom kreeg op een dag in de gevangenis een brief: “alle horloges in je kast zijn veilig”, wat betekent dat de vluchtelingen waren ontsnapt en veilig waren. Vier dagen na de inval brachten verzetsstrijders ze naar andere locaties. In totaal arresteerde de Gestapo meer dan 30 mensen die die dag in het ouderlijk huis waren.hoewel de Gestapo al snel de meeste van de 30 mensen die ze die dag gevangen hadden genomen vrijliet, werden Corrie, Betsie en hun vader Casper gevangen gehouden. Casper stierf tien dagen later. Corrie werd in eerste instantie in eenzame opsluiting vastgehouden., Na drie maanden werd ze naar haar eerste hoorzitting gebracht. Tijdens haar proces sprak Ten Boom over haar werk met mentaal gehandicapten; de Nazi luitenant bespotte, omdat de nazi ‘ s mentaal gehandicapten al jaren hadden vermoord in overeenstemming met hun eugenetische beleid. Ten Boom verdedigde haar werk door te zeggen dat in de ogen van God, een geestelijk gehandicapte persoon meer waard zou kunnen zijn “dan een horlogemaker. Of een luitenant.,Corrie en Betsie werden van Scheveningen naar Herzogenbusch gestuurd, een politiek concentratiekamp (ook bekend als Kamp Vught) en uiteindelijk naar het concentratiekamp Ravensbrück, een vrouwenarbeidskamp in Duitsland. Daar hielden ze erediensten na de zware dagen op het werk met behulp van een Bijbel die ze hadden weten binnen te smokkelen. Door hun leringen en voorbeelden van niet aflatende naastenliefde bekeerden Corrie en Betsie veel van de gevangenen daar tot het christendom.Terwijl ze gevangen zaten in Ravensbruck, begonnen Betsie en haar zus plannen te bespreken om na de oorlog een plek voor genezing te vinden., Betsie ‘ s gezondheid ging verder achteruit en ze stierf op 16 December 1944 op 59-jarige leeftijd. Voordat ze stierf, zei ze tegen Corrie: “er is geen put zo diep dat hij niet nog dieper is.”Twaalf dagen later werd Corrie vrijgelaten. Daarna werd haar verteld dat haar vrijlating het gevolg was van een administratieve fout en dat een week later alle vrouwen van haar leeftijdscategorie naar de gaskamers werden gestuurd.

Ten Boom keerde terug naar huis in het midden van de”hongerwinter”. Ze opent nog steeds haar deuren voor geestelijk gehandicapten die onderduiken uit angst voor executie.