Escherichia 바이러스 P1

Escherichia 바이러스 P1 은 주문 Caudovirales 및 가족 Myoviridae 에 속합니다. 그것은 일반적으로 파지 P1 이라고하며 대장균 대장균 에서 확인 된 최초의 박테리오파지 중 하나였습니다. Myoviridae 내의 작은 속 P1 바이러스의 대표 종이며,이는 또한 Aeromonas 바이러스 43 을 포함합니다., 광범위한 연구에서 파지 P1 에 크게 기여를 개척 개발에서는 1960 년대에서 DNA 재조합 기술을 포함하는 사이트별 재조합,제한,수정,복제의 큰 조각의 DNA 를 가지고 있습니다.

파지 P1 은 220nm 길이의 특징적인 긴 꼬리에 부착 된 대략 65-85nm 직경의 큰 icosahedral 헤드를 갖는다. 튜브와 같은 수축 시스를 둘러싸고 있 꼬리로 끝나는 기본 플레이트 및 비틀 꼬리 섬유의 90nm 길이 있습니다. 파지 헤드는 93kb 의 선형 dsDNA 게놈을 포함합니다., 파지 P1 의 완전한 게놈 서열은 적어도 117 개의 유전자를 암호화하고 각 5’및 3’말단에서 큰 특징적인 서열 중복성을 포함한다. 이러한 중복 시퀀스는 길이가 가변적이며 10~15kb 범위입니다. 숙주 세포로의 진입시,바이러스 DNA 는 중복 서열 사이의 재조합에 의해 신속한 순환 화를 겪는다. 이 동종 재조합은 숙주-인코딩 된 재조합 효소 또는 파지 구동,부위 특이 적 cre-lox 재조합 시스템에 의해 도움을받습니다., 후자의 경우에는,재조합 수익금 사이의 두 개의 loxP sites 위치한 터미널에서 중복되는 지역의 바이러스 게놈의 도움으로 파지-로 인코딩된”cre”단백질이다.

다른 caudovirales 와 마찬가지로,phage P1 은 lysogenic 또는 lytic 라이프 스타일을 채택 할 수있는 온화한 박테리오파지입니다. 결정을 입력하거나 용균성 또는 lysogenic 단계에 따라 달라집니스 환경에 영향을 미치는 요인의 전사 monomeric C1 진압을 조절하는 분자 면제의 살균 P1., 중 lysogeny,the circularized 살균 DNA(이하로 prophage)에 복제 호스트 세포질적으로 저렴한 복사본을 번호 플라스미드에서 원점 복제(oriR)을 이용하여 다양한 파지-로 인코딩된 단백질 또한 억제의 용균성 단계에 있습니다. 플라스미드 예언은 매우 안정하며 박테리아 숙주의 세포 분열에 따른 딸 세포에 의해 유전된다. 따라서 딸 세포로의 파지 P1 의 복제 및 분할은 엄격하게 조절된다. IncA 및 incC 부위에서 반복적 인 반복 서열과 함께 파지-인코딩 된 단백질 RepA 는 플라스미드 예언의 복제에 참여한다., 복제는 또한 파지 게놈에 대한 oriR 서열의 메틸화 상태와 박테리아 게놈에 대한 oriC 서열에 의해 영향을 받는다. DnaA,HU 및 다양한 샤페론과 같은 숙주 인자는 RepA 의 수정 및 원형화 된 예언 플라스미드의 복제에 참여한다. 박테리오파지 P7 과 P22 와 마찬가지로(살모넬라 sp 를 감염시킵니다.),파지 P1 은 2 개의 리프레서 분자(C1 단백질 및 C4RNA)를 사용하여 용해 단계를 억제한다., 다른 조절제로는 파지-인코딩 된 전달 RNA 분자,DNA 메틸 트랜스퍼 라제(MTR),전사 항 기생충(Coi 및 Ant1/2)및 공동 억제 단백질 Lxc 가 포함된다. 예언의 유도는 드물지만 숙주 환경의 자외선 손상 및 영양 변화에 반응하여 발생합니다. 숙주 전사 인자 LexA 단백질은 유도 과정에 관여한다. 파지 P1 은 lytic 단계에 대해 RepL 단백질을 코딩하는 유전자 내에 위치한 다른 복제 기원(oriL)을 사용합니다., 약 37 개의 바이러스 오페론이 박테리아 RNA 중합 효소에 의해 용해 단계 동안 전사된다. 효소 holoenzyme 형성에서 존재의 살균 로 인코딩된 Lpa 단백질의 수준의 규제에 의해 C1 진압은 분자 및 세균 엄격한 기아 단백질 SspA.

중요한 기능의 바이러스입니다”일반화 전달,”대신에 자신의 DNA,큰 조각의 호스트 세균 DNA 는 포장으로 한 소 머리입니다., 람다 파지와 달리,파지 P1 에 의한 일반화 된 형질 전환은 두 박테리아 숙주 균주 사이에 약 100kb 의 숙주 DNA 를 동원 할 수있다. 에 따라 변환로 받는 사람 세균성 변형,세균 유전자 때때로 통합 호스트에 게놈여 특정 사이트를 재조합. 결과적으로,형질 전환 된 박테리아는 용해되지 않으며 바이러스 감염으로 인한 독성을 겪지 않습니다.

파지 P1 의 숙주 범위는 Gammaproteobacteria 및 Enterobacteriaceae 에 속하는 대장균이다. 따라서이 파지의 분포는 유비쿼터스 숙주의 것을 반영한다., 바이러스의 전송을 포함 uniform 침투의 꼬리 내부 튜브로 대장균 periplasm 고 변화의 기본 플레이트에서 멀리 바깥 막는 동안 꼬리 위축에 있습니다. 꼬리 섬유는 외부 박테리아 막의 리포 폴리 사카 라이드 코어상의 포도당 모이어 티 인 특정 숙주 수용체에 결합한다. Lytic trans-glycosylase 는 박테리아 세포벽의 침투 및 숙주로의 파지 DNA 의 배출을 용이하게한다. 다른 침입하는 파지를 제외하고 박테리아 숙주에 면역을 부여하는”심”단백질이 빠르게 생산됩니다., 에 따라 항목으로 호스트,도입 DNA 남아있는 두 살균 로 인코딩된 단백질이라는 DarA 및 DarB(MTR 및 helicase)렌더링하는 바이러스의 DNA 를 방지하여 소화 enterobacterial 유형 I restriction endonucleases. 이후 E.coli 당지질 수용체 위해 살균 P1 에서 일반적인 여러 가지 그램 음성 박테리아,바이러스 입자의 흡착 수 있습에 외부 벽과 주입 DNA 으로 세포질의 많은 박테리아. 그러나 이러한 박테리아 종에서 후속 복제를 거칠 수는 없습니다., 검색의 시퀀스를 닮은 한 소 P1Cre recombinases 에 metaviromes 에서 복잡한 환경 및 enterobacteria 제안되는 추가 작업이 필요한을 풀어서 생물학의 이러한 페이지에서 다양한 환경 및 호스트가 있습니다. P1 관련 바이러스의 비교 게놈 시퀀싱(예를 들어,분류되지 않은 Punalikevirus 즉. 살균 D6,살균 phiW39,살균 RCS47 및 살균 SJ46 에서 식별한 다양한 enterobacteria)가 계시 통찰력을 소설 프로세스의 바이러스의 DNA 를 포장하는,특정 사이트를 재조합,그리고 면제.