自閉症の子供の中には、遺伝子に隣接して発現を制御するDNAセグメントにまれな突然変異を持ち、影響を受けていない父親からこれらの突然変異を受け継ぐ傾向があるという研究が今日Science1に発表された。

この発見は、ほとんどの研究が自閉症のリスクにおいて母親から継承された突然変異を関与させるため、予想外である。 このため、一部の専門家は結果に懐疑的です。,

この研究は、遺伝子外の突然変異が自閉症にどのように寄与するかを探求する最大のものであり、9,274個の全ゲノムの分析に基づいている。 そして、これらの非コーディング領域における”構造的変異体”—DNAの欠失または重複—に焦点を当てています。 一度”ジャンクDNA”として却下されると、これらの領域のいくつかは現在、遺伝子の発現を制御することが知られている。,

“これらは、臨床遺伝子検査を行った場合、以前は無視する変異体のタイプです”と、カリフォルニア大学サンディエゴ校のBeyster Center for Genomics And Neuropyschiatric Diseasesの主任研究員Jonathan Sebatは言います。

バリアント全体が自閉症の個人のわずかな割合を占めているが、推定0.39から1.13パーセントである。

“それは非常に低い”と範囲はかなり広い、Yufeng Shen、仕事に関与していなかったコロンビア大学のシステム生物学と生物医学情報学の助教授は述べています。, それは非常に良いことです”と彼は言いますが、”より大きなサンプルでは、この分数をより正確に推定することができます。”

精練配列：

Sebatと彼の同僚は、自閉症の少なくとも一人の子供を持つ311家族のゲノムの配列を決定しました。 彼らはまた、自閉症とその影響を受けていない両親と兄弟を持つ518人のゲノムを分析しました。

Sebatのチームは、100文字以上のDNA文字の構造変異体を検出しました。 彼らは、いずれかの人で約3,700のそのような継承された変種の平均を発見しました。,

その後、彼らは、一般集団ではめったに変異していない遺伝子に隣接する領域に焦点を当てました。 （代わりに、ゲノム全体を”不可知論的”な方法で見ることです。 彼らは自閉症の子供が偶然に期待されるように彼らの父からの約二倍のまれな変形を受継ぐことが分った。 対照的に、母親から継承されたまれな変種は、自閉症への貢献を最小限に抑える、と彼らは見つけた。 彼らは、自閉症に関連する非遺伝子変異、またはde novo突然変異を同定しなかった。

Sebatと彼の同僚は、2017年にプレプリントサーバーに結果を投稿しました。, 彼らはその後、自閉症の少なくとも一人の子供を持つ1,771家族からの配列の独立したサンプルで彼らの調査結果を検証しました。

この戦略は、科学的厳密さのための高いバーを設定し、Sebat氏は述べています。

“レプリケーションを行う前に、結果が何であるか、どのように分析を行ったかを皆に伝えました”と彼は言います。 “複製サンプルでどのような仮説をテストし、どのようにそれを行うのかについては完全に透明でした。”

他の人は、複製が研究の影響を高めると言います。, “私は結果の複製に励まされています”と、研究に関与していなかったシアトルのワシントン大学のゲノム科学教授であるEvan Eichler氏は言います。

結論を比較する：

しかし、Sebatの結果は、同じ配列のいくつかを分析した他の二つのチームからの結果と直接矛盾します。

アイヒラー率いるチームの一つは、彼らが非コーディングDNAに自閉症にリンクされている”de novo”変異を発見したことを報告しました。, 他のチームの研究は報道されていますが、この地域では自閉症に関連する遺伝型もde novo型も見つかりませんでした。

この不一致は、チームが使用したアルゴリズムと方法の違いによって部分的に説明される可能性がある、とワシントン州立大学スポケーン校の生物医学科の助教授であるLucia Peixotoは述べている。 “だから、彼らは本当に比較できません”と彼女は言います。 たとえば、pressの研究では、不可知論的アプローチを使用しました。,

Sebatの分析には、インデルと呼ばれる小さな欠失や重複も含まれていなかったが、これはより大きな変異体よりもゲノムにはるかに豊富である、とハーバード大学の神経学准教授であるMichael Talkowskiは、プレスで研究を共同主導したと述べている。 これらの結果をすべて分析に含めると、結論が変わる可能性があると彼は言います。

“これらは全ゲノム探索の初期の頃です”とTalkowskiは言います。, “私は、これらの研究全体で真の複製を評価し、同等の結論に達する前に、劇的に大きなサンプルが必要であり、注釈とアプローチを揃える必要があると”

保護効果：

結果は、自閉症の一般的な理論、”女性の保護効果と対立してもあります。”この理論によれば、女性は自閉症を引き起こす可能性のある突然変異から何らかの形で保護されていますが、時には突然変異を息子に渡すことがあ,

さらに、自閉症に関連する遺伝的変異体の他のクラスは、父方の遺伝パターンを示さない、とカリフォルニア大学サンフランシスコの精神医学助教授であるStephan Sanders氏は指摘している。 サンダースは、プレスの研究の指導者の一人でした。

“それは実質的な証拠があり、変異のいずれかのクラスで父方的に伝達された変異体の過剰を予測しない女性の保護効果を集計しない”と彼は言う。

Sebatは、調査結果はこの理論と矛盾していないと言います。, 彼は、自閉症は、母親から継承された強力なコーディング突然変異と、父親から継承された強力でないコーディング突然変異の組み合わせに起因する可能性があると言う。

彼のチームは、利用可能になるにつれて、より多くのゲノム全体を分析する予定です。 より大きなサンプルサイズで、Sebatは言う、彼はこの”二ヒット”仮説をテストすることができるようになります。 彼のチームはまた、彼らが発見した非コーディング突然変異の影響を探索しています。,

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この物語は、もともとSpectrumに掲載されました。