ヒト免疫不全ウイルスには二つの主要なタイプがあります。 最初に発見されたHIV-1は、世界中で最も普及しているタイプです。 HIV-2は55%以上HIV-1と遺伝的に異なっています。

HIV-2は西アフリカで最も一般的であり、インドでより一般的になってきていますが、数字はまだ比較的小さいです。 少数の症例は、ポルトガル、フランス、英国およびアメリカ大陸を含む他のヨーロッパ諸国でも見られ、主に西アフリカ出身の個人またはその性的パートナーで見られている。,

それぞれの主要なタイプのウイルスは、さらにグループに分類することができ、それ自体はクレードまたはサブタイプに細分することができる。 HIV-1は、グループM（メイン）、O（外れ値）、およびN（非MまたはO）を含む。

遺伝的差異のために、HIV-1およびHIV-2抗原は、診断試験がHIV-1を検出するためにのみ開発された場合、HIV-2を確実に検出することはできないほど ただし、両方のタイプのウイルスに敏感なテストが利用可能です。, HIV-2が一般的である国に住んでいたか、それらの国のいずれかから性的パートナーを持っていた人をテストする場合は特に、HIV-2に敏感なテストを使用 さらに、HIV感染の臨床的徴候（例えば、再発性日和見感染）を有するが、HIV-1のみに感受性のある検査に陽性を示さない場合、HIV-2に対する特異的な検査が適切である。

非ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤（NNRTI）クラスからの抗HIV薬は、HIV-2に対してアクティブではありません。, This includes efavirenz, rilpivirine, doravirine, etravirine and nevirapine. Regimens based on an integrase inhibitor, or a protease inhibitor, are recommended.