Risultati di Apprendimento
- Identificare le principali enzimi che svolgono un ruolo nella replicazione del DNA
Il processo di replicazione del DNA è catalizzata da un tipo di enzima chiamato DNA polimerasi (poly significato di molti, mer significato pezzi, e –ase significato enzima; quindi, un enzima che attacca molti pezzi di DNA). Osservare Figura 1: la doppia elica della molecola di DNA originale separa (blu) e nuovi fili sono fatti per abbinare i fili separati., Il risultato sarà due molecole di DNA, ciascuna contenente un vecchio e un nuovo filamento. Pertanto, la replicazione del DNA è chiamata semiconservativa. Il termine semiconservativo si riferisce al fatto che metà della molecola originale (uno dei due filamenti nella doppia elica) è “conservata” nella nuova molecola. Il filo originale è indicato come il filo del modello perché fornisce le informazioni, o il modello, per il filo appena sintetizzato.
Figura 1. Di Madprime (wikipedia) (DNA replication split orizzontale) CC BY-SA 2.,0
Figura 2. Primer e Template
La replicazione del DNA si basa sulla natura a doppio filamento della molecola. Una molecola di DNA a doppio filamento, una volta replicata, diventerà due molecole a doppio filamento, ciascuna contenente un filamento originale e un filamento appena sintetizzato. Ti ricordi che i due filamenti di DNA corrono antiparalleli: uno dal 5′ al 3′, e l’altro dal 3′ al 5′. La sintesi del nuovo filamento di DNA può avvenire solo in una direzione: dal 5′ al 3′ fine., In altre parole, le nuove basi vengono sempre aggiunte all’estremità 3′ del filamento di DNA appena sintetizzato. Quindi se il nuovo nucleotide viene sempre aggiunto all’estremità 3 ‘ di un nucleotide esistente,da dove viene il primo nucleotide? In effetti, la DNA polimerasi ha bisogno di un” ancoraggio “per iniziare ad aggiungere nucleotidi: una breve sequenza di DNA o RNA che è complementare al filamento del modello funzionerà per fornire un’estremità libera 3’. Questa sequenza è chiamata primer (Figura 2).
Come fa la DNA polimerasi a sapere in quale ordine aggiungere nucleotidi?, L’accoppiamento di base specifico nel DNA è la chiave per copiare il DNA: se si conosce la sequenza di un filamento, è possibile utilizzare le regole di accoppiamento di base per costruire l’altro filamento. Le basi formano coppie (coppie di basi) in un modo molto specifico. La figura 3 mostra come A (adenina) si accoppia con T (timina) e G (guanina) si accoppia con C (citosina). È importante ricordare che questo legame è specifico: T si accoppia con A, ma non con C. Il riconoscimento molecolare avviene a causa della capacità delle basi di formare specifici legami idrogeno: gli atomi si allineano giusto per rendere possibili legami idrogeno., Si noti inoltre che una base più grande (purina, A o G) si accoppia sempre con una base più piccola (pirimidina, C o T).
Figura 3. Struttura chimica del DNA. Modifica della struttura chimica del DNA da Madeleine Price Ball; CC-BY-SA-2.0
Domande di pratica
Vero / falso: la replicazione del DNA richiede un enzima.
Quali sono gli elementi costitutivi del DNA?
- Deoxyribonucleotides
- acidi Grassi
- Ribonucleotide
- Aminoacidi
Vero / Falso: la replicazione del DNA richiede energia.
Abbiamo gli elementi costitutivi, una fonte di energia e un catalizzatore. Cosa manca? Abbiamo bisogno di istruzioni sull’ordine dei nucleotidi nel nuovo polimero. Quale molecola fornisce queste istruzioni?,
- Proteine
- DNA
- Carboidrati
- Lipidi
C’è un’altra cosa richiesta dalla DNA polimerasi. Non può semplicemente iniziare a fare una copia del DNA del filamento del modello; ha bisogno di un breve pezzo di DNA o RNA con un gruppo idrossilico libero nel posto giusto per attaccare i nucleotidi., (Ricordate che la sintesi avviene sempre in una direzione – nuovi elementi costitutivi vengono aggiunti alla fine 3′.) Questo componente inizia il processo dando DNA polimerasi qualcosa a cui legarsi. Come si potrebbe chiamare questo breve pezzo di acido nucleico?
- Un solvente
- Un primer
- Un convertitore
- Un sigillante
Ora che comprendi le basi della replicazione del DNA, possiamo aggiungere un po ‘ di complessità. I due filamenti di DNA devono essere temporaneamente separati l’uno dall’altro; questo lavoro è svolto da un enzima speciale, l’elicasi, che aiuta a distendersi e separare le eliche del DNA (Figura 4). Un altro problema è che la DNA polimerasi funziona solo in una direzione lungo il filamento (5′ a 3’), ma il DNA a doppio filamento ha due filamenti orientati in direzioni opposte., Questo problema viene risolto sintetizzando i due fili in modo leggermente diverso: un nuovo filo cresce continuamente, l’altro in pezzi e pezzi. Brevi frammenti di RNA sono usati come primer per la DNA polimerasi.
Figura 4. Di Mariana Ruiz (DNA replication) Public Domain
Domande di pratica
Quale di queste separa i due filamenti complementari del DNA?,
- DNA polimerasi
- helicase
- RNA primer
- single-strand binding protein
Quale di queste collega basi complementari al filo del modello?
- DNA polimerasi
- elicasi
- RNA primer
- single-strand binding protein
Quale di questi viene successivamente sostituito con le basi del DNA?
- DNA polimerasi
- elicasi
- RNA primer
- single-strand binding protein
In sintesi: La replicazione degli enzimi principali
negli eucarioti inizia alle origini multiple della replicazione., È necessario un primer per avviare la sintesi, che viene poi esteso dalla DNA polimerasi in quanto aggiunge nucleotidi uno per uno alla catena di crescita. Il filo principale è sintetizzato continuamente, mentre il filo in ritardo è sintetizzato in brevi tratti chiamati frammenti di Okazaki. I primer RNA sono sostituiti con nucleotidi di DNA; il DNA rimane un filamento continuo collegando i frammenti di DNA con DNA ligasi. Di seguito è riportata una tabella riassuntiva dei principali enzimi trattati in questa lettura, elencati in ordine approssimativo di attività durante la replicazione.,NA
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