Hän perusti Mouratoglou Tennis Academy vuonna 1996 Pariisin lähellä (myöhemmin muutti laitamilla Mukava), ja on valmentanut monia ylös-ja-tulossa pelaajat, mukaan lukien Marcos Baghdatis (jota hän valmensi lopullinen 2006 Australian Open), Julia Vakulenko, Anastasia Pavlyuchenkova, Aravane Rezaï, Jérémy Chardy, Laura Robson, Janina Wickmayer ja Grigor Dimitrov.

Mouratoglou alkoi valmennus ATP-pelaaja Marcos Baghdatis vuonna 1999, kun Mouratoglou kutsui hänet hänen Tennis Academy lokakuussa 1999, yhden viikon perusteella., Baghdatis oli, mukaan Mouratoglou, ”ei urheilija ollenkaan”, kuitenkin viimeistään seitsemän vuoden kuluttua hän olisi tullut juniori maailman Nro 1, voittaa 2003 Australian Avointen poikien nimi, saavuttaa lopullinen saman turnauksen vuonna 2006 ja päästä maailman kymmenen.

heinäkuussa 2007, hän alkoi valmennus Anastasia Pavlyuchenkova. Pavlyuchenkova nousi kahdessa vuodessa maailman 30 parhaan joukkoon ja on sen jälkeen edennyt kaksiin Grand Slam-puolivälieriin ja yltänyt urallaan maailmanlistan sijalle 13. He lopettivat association elokuussa 2009, ja Mouratoglou siirtyi valmennus sekä Aravane Rezaï ja Janina Wickmayer., Rezaï nauttia onnistuneen 2010 kausi, on tullut maailman top 20 ja voittaa Premier tapahtuma Madridissa, vaikka Wickmayer saavutti uran korkea sijoitusta maailman Nro 12. huhtikuuta 2010. Mouratoglou lakkasi toimimasta kanssa sekä Rezaï ja Wickmayer elokuussa 2010 ja huhtikuussa 2012.

joulukuussa 2010, Mouratoglou alkoi valmentaa Laura Robson, joka oli maailman Nro 217 tuolloin ja on edelleen vaikeuksia murtautua senior tour., He työskentelivät yhdessä kuusi kuukautta ennen erottamalla vähän ennen Wimbledonin vuonna 2011, kun Robson oli vielä kamppailee tehdä minkäänlaista edistystä, WTA Tour, joilla liukastui edelleen maailman Nro 257. Samana aikana Mouratoglou valmensi myös Jérémy Chardya akatemiassaan.

Maaliskuussa 2012, Mouratoglou alkoi valmennus Grigor Dimitrov ja asettaa noin ohjaavat hänet takaisin osaksi maailman top 100, ottaa putosi Nro 102 kun hän alkoi. Seura päättyi saman vuoden syyskuussa, ja Mouratoglou siirtyi nykyiseen tehtäväänsä valmentaen yksinomaan Serena Williamsia.,

kun Mouratoglou alkoi valmennus Williams, hän oli kärsinyt hänen ensimmäinen avauskierroksella tappion tärkein tehtävä on Grand Slam-turnaus, menettää ensimmäisellä kierroksella vuoden 2012 ranskan Avointen. Koska sitten, Mouratoglou on ohjannut Williams hänelle viidennen, kuudennen ja seitsemännen Wimbledon otsikot, Olympialaisten kultamitalin, hänen neljäs, viides, ja kuudes US Open otsikot, hänen toinen ja kolmas ranskan Avointen otsikot, kolmen peräkkäisen vuoden lopussa mestaruutta otsikot, hänen kuudes ja seitsemäs Australian Open otsikko ja nosti hänet takaisin maailman Nro 1 WTA rankingissa.,

Vuonna 2018, Stefanos Tsitsipas aloitti koulutuksen vuonna hänen tennis academy, samoin kuin on valmentanut Patrick Mouratoglou ja hänen isänsä Apostolos Tsitsipas.