Onkologia Kirjaimia

Johdanto

nenänielusyöpä (NPC) on yksi mostcommon pahanlaatuisia kasvaimia pään ja kaulan (1). NPC: llä on ainutlaatuinen maantieteellinen jakauma, ja sitä esiintyy Kaakkois-Aasiassa, Lähi-idässä ja Pohjois-Afrikassa (1). Endemikaarilla NPC-esiintyvyys voi olla jopa 35 tapausta 100 000: ta keski-ikäistä miestä kohti (2)., 5-vuoden eloonjääminen potilailla, joilla on varhaisen vaiheen NPC on jopa 95%,kuitenkin, eloonjäämisaste potilailla, joilla on pitkälle edennyt NPC on vain ~60% (3,4), ja 70% on äskettäin diagnosoitu potilailla withNPC on locoregionally on pitkälle edennyt sairaus (5). Siksi potentiaalisten markkinoijien tutkiminen varhaisen vaiheen NPC-potilaiden tunnistamiseksi on tärkeää potilaiden hoitotulosten parantamiseksi.

läsnäolo Epstein-Barrin virus (EBV) DNA inplasma on tällä hetkellä käytetty seulonta oireettomilla potilailla withNPC, kuitenkin, sen positiivinen ennustearvo kasvain seulonta on suhteellisen alhainen (11%) (6).,Lisäksi kertyvät todisteet osoittavat, että polygenes andcell polkuja, mukaan lukien transforming growth factor-β signalingpathway ja Notch signalointi reitin, voi edistää kehittämistä ja etenemistä NPC (7-9).

tarkka molekyylitason mekanismit theprogression NPC jäädä epäselväksi, varhainen diagnoosi ja injektiokäyttöä NPC on tällä hetkellä rajoitettu (10,11).Siksi lisätutkimuksia selvittämään molekyylitason mechanismsinvolved vuonna NPC leviämisen ja etenemiseen tarvitaan kattavan ymmärrystä NPC syövän.,

Gene microarray, jotka ovat korkea-throughputplatforms analyysi geenien ilmentyminen, jotta theidentification satoja eri tavoin ilmaistuna geenit (DEGs)mukana eri signalointireittien, molekyyli toimintoja andbiological prosesseja (12-14). Riippumattomien tutkimuslaitosten antamia vertailevia analyyseja (15,16) tehtiin kuitenkin vain vähän päällekkäisyyksiä. Microarray teknologioiden jabioinformatiikan työkalujen yhdistäminen parantaa analysoinnin tehokkuutta ja tarkkuutta (15,16)., Wang et al (15) ja Jiang et al (16) analysoitiin GSE12452 aineisto, whichcontained 31 NPC näytteitä ja 10 normaali control-näytteet, jotka identifythe keskeisten geenien mukana NPC. Kuitenkin, määrä samplesincluded näissä kahdessa tutkimuksessa oli suhteellisen pieni, ja themolecular reittejä mukana NPC syövän edelleen epäselvä.Tässä tutkimuksessa GSE12452 (17), GSE34573 (18) ja GSE64634 (19) aineistot olivat ladata GeneExpression Omnibus-tietokanta (GEO; www.ncbi.nlm.nih.gov/geo; GPL570 Affymetrix Ihmisen Genomin U133 Plus 2.0 Array) tunnistaa DEGs inNPC kudoksiin., Myöhemmin gene ontology (GO; www.geneontology.org) ja väylän rikastusanalysaattoritehtiin avaintyyppisten geenien biologisten toimintojen ja reittien tunnistamiseksi (20). Tulokset käsiteltävänä oleva tutkimus tarjoaa romaani oivalluksia mahdollisia biomerkkiaineita forNPC ja voi edistää nykyistä käsitystä themolecular mekanismit NPC leviämisen andprogression.

Materiaalit ja menetelmät

Microarray data

Kolme gene expression profiles (GSE12452, GSE34573,ja GSE64634) oli ladata GEO-tietokanta., GSE12452,joka perustui Affymetrix GPL570 foorumi , toimitettiin vuoteen Ahlquist et al (17). Gse12452-aineistossa oli 31 NPS-näytettä ja 10 normaalia NPC-näytettä. Analyysin differentialgene ilmaisun välillä kasvaimen ja normaalin kudoksen suoritettiin usingGeneSpring ohjelmisto, versio 11.5 (Agilent Technologies, Inc., SantaClara, CA, Yhdysvallat). GSE34573 esittämä Hu et al (18), perustui Affymetrix GPL570platform ja koostui 16 NPC näytteet ja 3 normaalia controlsamples., GSE64634 esittämä Xiong et al, perustui onthe Affymetrix GPL570 alustan ja koostui 12 NPC samplesand 4 normaalia tarkastuksia (19). Astudentin t-testillä tunnistettiin Degit, joiden muutos oli≥2-kertainen. P<0.05 katsottiin osoittavan statisticallysignificant ero.

MENNÄ ja reitti rikastamiseen analyysi ofDEGs

MENE analyysi ja Kyoto Encyclopedia of Genes andGenomes (KEGG; www.genome.jp/kegg/pathway.html) polun analyysi wereconducted tunnistaa DEGs klo biologisesti toiminnallinen taso(21)., Tietokantaan Merkintä,Visualisointi, ja Integroitu Löytö (DAVID; david.abcc.ncifcrf.gov) käytettiin integratefunctional genomista merkinnät (22). P<0, 05 katsottiin merkitsevän astatistisesti merkittävää eroa (23).

Integrointi proteiini-proteininteraction (PPI) – verkkoon

Haku Työkalu Haku InteractingGenes versio 10.0 (STRING; string-db.org) käytettiin etsintä ofpotential ASTETTA vuorovaikutus proteiini tasolla (24). Stringweren antamat DEGs: n PPI-verkot on johdettu validoiduista kokeista (25)., PPI-pistemäärä >0,4 katsottiin merkittäväksi. PPI-verkot olivat visualisoidaan Cytoscapesoftware (http://www.cytoscape.org) (26). P<0, 05 katsottiin merkitsevän astatistisesti merkittävää eroa.

Tulokset

Tunnistaminen DEGs

NPC ja normaali näytteet (59 ja 17, vastaavasti)olivat ensin analysoidaan. GeneSpring-ohjelmistoa käytettiin kunkin sirun teesioiden analysointiin ja Degien tunnistamiseen., Seuraava analyysi ofGSE12452, GSE34573, GSE64634 aineistot, 1,301 (553 upregulated and748 downregulated), 1,232 (348 upregulated ja 884 downregulated)ja 1,218 (555 upregulated ja 663 downregulated) geenit wereidentified, vastaavasti. Kantojen klusterianalyysin tulokset paljastivat merkittäviä eroja normaalin nielukudoksen ja NPC-näytteiden välillä (Kuva. 1). Käyttäen Venn-kaavio analyysi, 268DEGs (59 upregulated ja 209 downregulated) risteyksessä näistä kolme aineistot valittiin analysoitavaksi(Kuva. 2).,

SIIRRY aikavälillä rikastamiseen analyysi

tunnistettu DEGs oli ladattu onlinesoftware DAVID GO ja KEGG pathway-analyysit. Tulokset theGO-analyysi paljasti, että upregulated DEGs olivat significantlyenriched biologisia prosesseja, kuten solujen tarttumista’, ’celldivision’, ’mitoosin” ja ” mitoosi-solun sykli (Taulukko I; Fig.3 A). Se downregulated DEGs olivat pääasiassa rikastettu’microtubule-pohjainen liike’, ’ripsi-liikkeen’, ’ripsi axonemeassembly” ja ” epiteelisolujen erilaistumista (Taulukko I; Fig.3 B)., Kannalta molekyyli-toiminto, upregulated DEGs wereenriched vuonna fosfatidyyli-välitteinen signalointi’, ja thedownregulated DEGs olivat rikastettu ’axonemal dynein complexassembly (Taulukko I).

Taulukko I.

Gene ontologia analyysi ofdifferentially ilmaisi geenejä, jotka liittyvät nasopharyngealcarcinoma.,

KEGG pathway analysis

KEGG pathway analyysi paljasti, että upregulatedDEGs olivat erittäin liittyvät väylät mukaan lukien ECM-receptorinteraction’, ’ihmisen papilloomaviruksen infektio’, ’arrhythmogenicright kammion kardiomyopatia” ja ” polttovälin tarttuvuus (Taulukko II; Fig.4 A). Se downregulated DEGs olivat rikastettu ’metabolicpathways’, ’Huntingtonin tauti’, ’nesteen leikkausjännitys’,’ateroskleroosi” ja ” kemiallinen karsinogeneesi (Taulukko II; Fig.4 B).,

Taulukko II.

Kyoto Encyclopedia Analyysi Genesand Genomien polun analyysi DEGs liittyvät nasopharyngealcarcinoma.

PPI-verkosto

DEG ilmaisun profiilit NPC olivat constructedaccording tietojen MERKKIJONON tietokantaan. Eristettyjen ja osittain liitettyjen solmujen iminoinnin jälkeen rakennettiin ofDEGs-verkko(Kuva. 5)., Thetop 10 hub geenit, jotka olivat geenejä, joilla useimmatmerkittävä vuorovaikutus, mukana dynein axonemal lightintermediate ketju 1 (DNALI1), dynein axonemal väli-ketju 2(DNAI2), calmodulin 1 (CALM1), kelattu-kela verkkotunnuksen, joka sisältää 114(CCDC114), dynein axonemal raskas ketju 5 (DNAH5), radial spoke head9 homolog (RSPH9), radial spoke pään osan 4 A (RSPH4A), NDC80kinetochore monimutkainen komponentti (NDC80), tymidylaattisyn syntetaasin(TYMS) ja rulla-kela verkkotunnuksen, joka sisältää 39 (CCDC39). Dnali1demonstrated korkein solmu aste 18.,

Keskustelu

NPC on yksi yleisimmistä pään ja kaulan levyepiteelikasvaimista (1). Vaiheen I tautia sairastavien potilaiden 5-vuotisturvivalenssi on 95% (3). Vaiheen IV tautia sairastavien potilaiden 5-vuotinen eloonjäämisaste on kuitenkin hieman yli 60% (27). Siksi, ymmärtää, theetiological tekijöitä ja molekyylitason mekanismeja NPC etenemistä välttämätöntä, diagnosointiin ja hoitoon. Mikrosiruteknologiaa on sovellettu laajalti karsinooman mahdollisen terapeuttisen tavoitetason ennustamiseen, mukaan lukien kolorektaalisyöpä (12-14).,Aiemmin Wang et al (15)analysoitiin GSE12452 aineisto ja kävi ilmi, että pyöräily kyp B1, mitoticarrest puutteellinen 2 kuin 1, lisääntyvien solujen tuman antigeeni,musiini 1, solun pinnalla liittyvät ja aldehydidehydrogenaasin 1family jäsen A1 voi olla mukana EBV-liittyvät NPC (15). Tutkimuksessa analysoidaan GSE12452 datasetsuggested, että C-X-C motif kemokiinin ligandin (CXCL) 9, ZIC familymember 2, prostaglandiini-endoperoksidi synthase 2, fibronektiini 1,CXCL10 ja ovo, kuten transkription repressori 1 voi palvella roolit inNPC (16)., Yksittäisten tietokokonaisuuksien hakijamäärä oli kuitenkin suhteellisen pieni (15,16). Tässä tutkimuksessa analysoitiin 3 aineistoa ja analysoitiin 53 ajantasaista ja 209 säädeltyä Nollaa bioinformatikianalyysin avulla.,

tulokset KEGG pathway rikastamiseen analysisand GO-toiminto kommentointi paljasti, että upregulated DEGs weremainly rikastettu ’solun tarttumista’, ’solunjakautumisen’, ’mitoosin,”mitoosi-solun syklin’, ’ECM-reseptorin vuorovaikutus” ja ”humanpapillomavirus infektio’, kun taas downregulated DEGs olivat mainlyinvolved vuonna axonemal dynein monimutkainen kokoonpano’, ’microtubule-basedmovement’, ’metaboliareittien’, ’Huntingtonin tauti’, ’fluidshear stressiä” ja ”ateroskleroosi” ja ”kemiallinen karsinogeneesi’.,Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että ylösajon ordownregulation geenejä, voi vaikuttaa NPC-solujen invaasio,etäpesäke, proliferaation ja apoptoosin (28-30).Tämä tulos on sopusoinnussa sen kanssa, että syöpä cellinvasion ja etäpesäkkeiden liittyvät läheisesti epänormaalia celladhesion ja solunjakautumisen (28-30).Lisäksi syöpäsolujen proliferaatio ja apoptoosi liittyvät läheisesti mitoottisen solusyklin (28-30) poikkeavuuksiin., Aprevious tutkimus osoitti, että paksu-ja peräsuolen syövän solut vuorovaikutuksessa withstromal soluja tuottamalla ECM komponenttien, välittäjänä directcell-cell yhteyttä ja erittävät kasvutekijöitä (31). Lisäksi, olemassa olevat todisteet hasdemonstrated, että muutoksia solujen DNA: ta ja histones iscaused, jonka välituotteita solun aineenvaihduntareitit (32). Näin ollen, analyysi signalingpathways mukana voi tarjota uusia oivalluksia, ymmärrystä cancercell leviämisen.

tässä tutkimuksessa rakennettiin PPI-verkosto tunnistamaan 10 merkittävintä hub-geeniä., Nämä olivat seuraavasti: DNALI1, DNAI2, CALM1, CCDC114, DNAH5, RSPH9, RSPH4A,NDC80, TYMS, ja CCDC39. Dnali1 oli hub-geeni, jolla oli huomattavin yhteysaste. Peng et al (33) kävi ilmi, että mRNA-tasot DNALI1were merkittävästi potilailla, joilla on allerginen nenän mucosacompared verrokeilla (P<0.05). Parris et al (34) kertoi, että useita pahanlaatuisia tumorswith normaali geeni annostus tasot näkyviin DNALI1 downregulation,mikä viittaa siihen, että DNALI1 voi olla uusi terapeuttinen tavoite cancerdrug kehitystä., Toinen tunnistettu hub-geeni, DNAI2, joka on isalso-proteiinin koodaus, liittyy primääriseen ciliarydyskinesiaan (PCD) (35). DNAI2 andforkhead box J1 on ciliated cell markers (36). Kolmas hub-geeni, CALM1, on yksi niistä, jotka koodaavat calmoduliiniproteiinia (37). Kim et al (38) toteutettiin laajamittainen genomin analysesfor rintasyöpä, ja tulokset osoittivat, että potentialregulator proteiini kinaasi B, CALM1 oli erittäin ilmaisi inphosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinaasi katalyyttinen subunita-mutatoitunut rintasyöpä., Lisäksi, kalsium-sitova proteinsCALM1, calumenin ja reticulocalbin 1, olivat significantlyupregulated säteilytetty kasvain solut, jotka joutuivat tohypoxia, mikä osoittaa, että näitä välittäjiä palvella tärkeä rooli inpromoting kasvain solujen eloonjäämistä aikana hypoksia (39). Samanlainen DNAI2, CCDC114 on yksi niistä PCD-liittyvät geenit, jotka loss-of-function mutationsresult vuonna PCD kanssa laterality epämuodostumia, joihin liittyy sydän vikoja(40). Ilman ormislocalization toisen navan geeni, DNAH5, on characteristicmarker varten liikkuvien ciliary poikkeavuus, nenän polyypit (41)., Loput viisi hub geenien lahja tutkimuksessa olivat RSPH9, RSPH4A, NDC80, TYMS ja CCDC39. Yoonet al (42) kertoi, että theRSPH9 metylaatio kuvio on ennusteen indikaattori patientswith nonmuscle invasiivinen virtsarakon syöpä. RSPH9 ja RSPH4A ovat radialspoke pää proteiini geenit, jossa mutaatiot aiheuttavat ensisijainen ciliarydyskinesia keski-microtubular-pari poikkeavuuksia (43). TYMS on keskeinen entsyymi denovo synteesi 2′-deoxythymidine-5′-monofosfaatti from2′-deoxyuridine-5′-monofosfaatti (44)., CCDC39 ja CCDC40 olivat firstidentified kuin mutaatioita aiheuttava potilailla, joilla on ensisijainen ciliarydyskinesia ja ovat todennäköisesti mukana rekrytointi oftubulin glutamylase(s) flagella (45), jota ei ole tunnistettu beassociated kehittämisen kanssa NPC.

yhteenvetona, nykyinen tutkimus toteutettiin kattavan bioinformatiikka-analyysi DEGs, joka voi olla varainhoidossaja NPC etenemistä. Tulokset voivat antaa uusia oivalluksia, joita voidaan käyttää NPC: n taustalla olevien molekulaaristen mekanismien tulevaan tutkimiseen., Tunnistettujen geenien ominaisfunktiot NPC: ssä on kuitenkin vahvistettava molekulaarisilla lisäkokeilla.

kuittaukset

Ei oleellinen.

rahoitusta

rahoitusta ei saatu.

tietojen Saatavuus ja materiaalit

aineistot käytetty tässä tutkimuksessa saatavilla vastaavasta tekijä, kun reasonablerequest.

tekijöiden osuudet

HMZ ja QF suunnittelivat ja suunnittelivat tutkimuksen. HMZ, QF, LXQ, BLL, LY ja XH tekivät bioinformatiikan analyysin. Lxqand BLL analysoi tiedot. HMZ ja QF kirjoittivat käsikirjoituksen., LY andXH tarkasteli ja tarkisti käsikirjoituksen. Kaikki kirjoittajat lukivat ja hyväksyivät lopullisen käsikirjoituksen.

etiikan hyväksyntä ja suostumus topartipaatti

Ei oleellinen.

potilaan suostumus julkaisemiseen

Ei oleellinen.

kilpailevat intressit

tekijät ilmoittavat, ettei heillä ole kilpailevia intressejä.,ochore complexcomponent

TYMS

thymidylate synthetase

CCDC39

coiled-coil domain containing 39

PCD

primary ciliary dyskinesia

Chua MLK, Wee JTS, Hui EP and Chan ATC:Nasopharyngeal carcinoma., Lancet. 387:1012–1024. 2016. Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

– Li K, Lin GZ, Shen JC ja Zhou K: Timetrends nenänielusyöpä kaupunkien Guangzhou yli a12-vuoden aikana (2000-2011): Lasku sekä esiintyvyys andmortality. Aasialainen Pac J Syöpä Prev. 15:9899–9903. 2014., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Lee JW, Sze VM, Au JS, Leung TF, Leung TW,Chua DT, Zee EKR, Laki SC, Teo PM, Tung SY, et al: Hoito resultsfor nenänielun karsinooma in moderni aikakausi: Hong Kongexperience. Int J Radiat Oncol Biol Phys. 61:1107–1116. 2005.,Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Jing L, Zou X, Wu YL, Guo JC, Yun JP, XuM, Feng QS, Chen LZ, Bei JX, Zeng YX ja Chen MINUN: A comparisonbetween Kuudennen ja seitsemännen edition-versiot UICC/AJCC stagingsystem varten nenänielun karsinooma in Kiinan kohortti. PLoS Yksi.9: e1162612014., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Pan JJ, Ng WT, Zong JF, Lee SW, Choi HC,Chan VL, Lin SJ, Guo AY, Sze HC, Chen UJ, et al.: Prognosticnomogram puhdistettavaksi ennustus ehdotetun 8thedition ja AJCC/lavastus UICC järjestelmä nenänielun cancerin aikakauden intensiteetti-moduloitu sädehoitoa. Syöpä.122:3307–3315. 2016., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Chan KCA, WOO JKS, Kuningas, Zee BCY, LamWKJ, Chan SL, Chu SWI, Mak C, Tse IOL, Leung SYM, et al.: Analyysi plasma-Epstein-Barr-viruksen DNA: n näytön nasopharyngealcancer. Uusi Engl J Med. 377:513–522. 2017. Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Tulalamba W ja Janvilisri T:nenänielusyöpä signalointireitti: päivityksen molecularbiomarkers. Int J Cell Biol., 2012:5946812012. Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Huang G, Du MINUN, Zhu H, Zhang N, Lu ZW,Qian LX, Zhang W, Tian X, X ja Yin L: MiRNA-34 a reversedTGF-β aiheuttama epiteelin-mesenkymaalitransitioon kautta tukahduttaminen ofSMAD4 vuonna NPC-soluja. Biomed Pharmacuther. 106:217–224. 2018.,Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Zhu HM, Jiang XS, Li HZ, Qian LX, Du MINUN,Lu MV, Wu J, Tian XK, Fei K, X ja Yin L: miR-184 estää tumorinvasion, maahanmuutto-ja etäpesäke nenänielusyöpä bytargeting Notch2. Cell Physiol Biochem. 49:1564–1576. 2018.,Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Coghill AE, Hsu WL, Pfeiffer RM, Juana H,Yu KJ, Lou PJ, Wang CP, Chen W, Chen TC, Middeldorp JM andHildesheim On: Epstein-Barr-virus serologia mahdollisena screeningmarker varten nenänielusyöpä keskuudessa korkean riskin individualsfrom multiplex perheet Taiwanissa. Cancer Epidemiol BiomarkersPrev. 23:1213–1219. 2014., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Ng WT, Yau TK, Yung RW, Sze VM, Tsang AH,Laki AL ja Lee AW: Seulonta perheenjäsenet potilaiden withnasopharyngeal karsinooma. Int J Syöpä. 113:998–1001. 2005.Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Kulasingam V ja Diamandis EP: Strategiesfor löytää romaani syövän biomarkkereita kautta käyttöaste ofemerging teknologioita. Nat Clin Pract Oncol. 5:588–599. 2008.,View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Nannini M, Pantaleo MA, Maleddu A, AstolfiA, Formica S and Biasco G: Gene expression profiling in colorectalcancer using microarray technologies: Results and perspectives.Cancer Treat Rev. 35:201–209. 2009. View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Bustin SA and Dorudi S: Gene expressionprofiling for molecular staging and prognosis prediction incolorectal cancer., Asiantuntija Rev Mol Diagn. 4:599–607. 2004.Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Wang J, Mei F, Gao X ja Wang S:Tunnistaminen geenit mukana Epstein-Barr virus-associatednasopharyngeal karsinooma. Oncol Lett. 12:2375–2380. 2016.Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Jiang X, Feng L, Dai B, Li L ja Lu W:Tunnistaminen keskeisten geenien mukana nenänielusyöpä.Braz J Otorhinolaryngol. 83:670–676. 2017., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Sengupta S, den Boon JA, Chen IH, NewtonMA, Dahl DB, Chen M, Cheng YJ, Westra WH, Chen TC, Hildesheim A, et al: Genome-wide ilmaisun profilointi paljastaa EBV-associatedinhibition ja MHC-Luokan I-ilmaisun nenänielusyöpä.Syöpä Res. 66: 7999-8006. 2006., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Hu C, Wei W, Chen X, Woodman CB, Yao Y,Nicholls JM, Jooab minä, Sihota SK, Shao JY, Derkaoui KD, ym: Maailmanlaajuista näkymä onkogeenisten maisema nenänielusyöpä:Integroitu analyysi geneettisellä ja ilmaisun tasoilla. Plosoni. 7: e410552012., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Bo S, Gong Z, Zhang W, Li X, Zeng Y, LiaoQ, Chen S, Shi L, Lian Y, Jing Y, et al.: Upregulated longnon-koodaus RNA AFAP1-AS1 ilmaus liittyy progressionand huono ennuste nenänielusyöpä. Oncotarget.6:20404–20418. 2015., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Tweedie S, M Ashburner, Kuuluu K, LeylandP, McQuilton P, Marygold S, Millburn G, Osumi-Sutherland D,Schröder A, Tiiviste R, et al: FlyBase: Parantaa Drosophila geneontology merkintöjä. Nukleiinihapot Res. 37: (Tietokantanumero).D555-D559. 2009. Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Kanehisa M ja Goto S: KEGG: Kyotoencyclopedia geenien ja genomien. Nukleiinihapot Res. 28: 27-30.2000., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Dennis G Jr, Sherman BT, Hosack DA, YangJ, Gao W, Lane HC ja Lempicki RA: DAVID: Tietokannan merkintä,visualisointi, ja integroitu löytö. Genomibiolia. 4: P32003.Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Huang da W, Sherman BT ja Lempicki RA:Järjestelmällinen ja integroiva analyysi suurten geeni luettelot käyttäen DAVIDbioinformatics resursseja. Nat-Protokolla. 4:44–57. 2009., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Szklarczyk D, Franceschini A, Wyder S,K Forslund, Heller D, Huerta-Cepas J, Simonovic M, Roth A, SantosA, Tsafou TAN, et al: STRING v10: proteiini-Proteiini interactionnetworks, integroitu yli elämän puu. Nukleiinihapot Res. 43: (Tietokantanumero). D447-D452. 2015., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Franceschini A, Szklarczyk D, Frankild S,Kuhn M, Simonovic M, Roth A, Lin J, Minguez P, Bork P, von Ingrahm Cand Jensen LJ: STRING v9. 1: proteiinin ja proteiinin vuorovaikutusverkostot, joissa kattavuus ja integraatio lisääntyvät. Nukleiinihapot Res. 41: (Tietokantanumero). D808-D815. 2013., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Shannon P, Markiel A, Ozier O, Baliga NS,Wang JT, Ramage D, Amin N, Schwikowski B ja Ideker T: Cytoscape: Asoftware ympäristöön integroituja malleja biomolecularinteraction verkostoja. Genomi Res. 13: 2498-2504. 2003., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Li J, Zou X, Wu YL, Guo JC, Yun JP, Xu M,Feng QS, Chen LZ, Bei JX, Zeng YX ja Chen MINUN: Vertailu välinen Kuudes ja Seitsemäs edition-Versiot UICC/AJCC lavastus Järjestelmä fornasopharyngeal karsinooma in Kiinan kohortti. PLoS Yksi.9: e1162612014., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Qi XK, Han HQ, Zhang HJ, Xu M, Li L, ChenL, Xiang T, Feng QS, Kang T, Qian CN, et al.: OVOL2 linkkejä stemnessand etäpesäke kautta hienosäätöä epiteelin-mesenkymaalitransitioon innasopharyngeal karsinooma. Theranostics. 8:2202–2216. 2018.,Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Gao K, Tang L, Wu L, Li K, Wang H, Li,Wu J, Li M, Wang S, ja Zhao L: LASP1 edistää nasopharyngealcarcinoma etenemistä läpi negatiivisesti asetuksen tumorsuppressor PTEN. Sellikuolema. 9:3932018., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Ren X, Yang X, Cheng B, Chen X, Zhang T,Hän Q, Li B, Li Y, Tang X, Wen X, et al: HOPX hypermethylationpromotes etäpesäke kautta aktivoimalla ETANA transkriptio innasopharyngeal karsinooma. Nat Commun. 8:140532017., View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Vicente CM, Ricci R, Nader HB and Toma L:Syndecan-2 is upregulated in colorectal cancer cells throughinteractions with extracellular matrix produced by stromalfibroblasts. BMC Cell Biol. 14:252013. View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Schvartzman JM, Thompson CB and FinleyLWS: Metabolic regulation of chromatin modifications and geneexpression. J Cell Biol. 217:2247–2259. 2018., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Peng Y, Chen Z, Guan WJ, Zhu Z, Tan TAN,Hong S, Zi X, Zeng J, Li Y, Ong YK, ym: Downregulation andaberrant lokalisointi Forkhead Box J1 allerginen nenän limakalvon.Int Arch Allergy Immunol. 176:115–123. 2018., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Parris TZ, Danielsson A, Nemes S, KovácsA, Delle U, Fallenius G, Möllerström E, Karlsson S ja Helou K:Kliinisiä vaikutuksia geeni annostus ja geenien ilmentyminen patternsin diploidi rintasyöpä. Clin Cancer Res. 16: 3860-3874. 2010.,Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Fedick OLEN, Jalas C, Treff NR, Knowles MRand Zariwala MA: Operaattorin taajuudet yksitoista mutaatioita eightgenes liittyy primaari siliaarinen dyskinesia AshkenaziJewish väestöstä. Mol Genet Genomic Med. 3:137–142. 2015.,Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Milara J, Armengot M, Bañuls P, Tenori S,Beume R, Artigues E ja Cortijo J: Roflumilasti-N-oksidi, että PDE4inhibitor, parantaa ripset liikkuvuutta ja värekarvallinen ihmisen bronchialepithelial solujen vaarantunut tupakansavun in vitro. Br JPharmacol. 166:2243–2262. 2012., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Weile J, Sun, S, Cote AG, Knapp J, Verby M,Mellor JC, Wu Y, Pons C, Wong C, van Lieshout N, ym: puitteet tyhjentävästi kartoitus toiminnallinen näin variantteja. Mol SystBiol. 13:9572017., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Kim JY, Lee E, Puisto K, Park, WY, Jung HH,Ahn JS, Im LV-ja Puisto LV: Kliiniset vaikutukset genomicprofiles metastasoituneen rintasyövän hoidossa keskitytään TP53 andPIK3CA, yleisimmin mutatoituneet geenit. Oncotarget.8:27997–28007. 2017.,PubMed/NCBI

Ren Y, Yeoh KW, Hao P, Kon-OL ja Sze SK:Säteilytys epiteelin karsinooma solujen upregulatescalcium-sitovia proteiineja, jotka edistävät selviytymisen alle hypoxicconditions. J Proteome Res. 15: 4258-4264. 2016., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Onoufriadis A, Paff T, Antonius D, ShoemarkA, Lou D, Kuyt B, Schmidts M, Petridi S, Dankert-Roelse JE,Haarman ESIM, et al.: Splice-site mutaatioita axonemal outerdynein käden telakointi monimutkainen geeni CCDC114 aiheuttaa ensisijainen ciliarydyskinesia. Olen J Hum Genet. 92:88–98. 2013., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Qiu Q, Peng Y, Zhu Z, Z Chen, Zhang C, OngHH, Tan TAN, Hong S, Yan Y, Huang S, et al.: Ilman ormislocalization ja DNAH5 on ominainen markkeri motileciliary poikkeavuus nenän polyypit. Laryngoskooppi. 128: E97–E104.2018., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Yoon HY, Kim YJ, Kim JS, Kim YW, Kang HW,Kim WT, Yun SJ, Ryu KH, Lee SC ja Kim WJ: RSPH9 methylationpattern prognostisena indikaattori potilailla, joilla on ei-muscleinvasive virtsarakon syöpä. 35: 1195-1203. 2016., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Kaya VH, Romio L, Chodhari R, HirstRA, de Castro SC, Parker KA, Ybot-Gonzalez P, Emes RD, Wilson SW,Wallis C, et al.: Mutaatiot radial spoke pää proteiini geenit RSPH9and RSPH4A aiheuttaa primaarinen siliaarinen dyskinesia withcentral-microtubular-pari poikkeavuuksia. Olen J Hum Genet.84:197–209. 2009., Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Wang X, Guan Z, Dong Y, Zhu Z, Wang J andNiu B: n Inhibitio tymidylaattisyn nopaliinisyntaasin vaikuttaa hermo tubedevelopment hiirillä. Nuhtele Toxicolia. 76:17–25. 2018. Näytä Artikkeli : Google Scholar : PubMed/NCBI

Lin H, Zhang Z, Guo S, Chen F, Kessler JM,Wang YM ja Dutcher SK: ALEKSANDER liittyvä kinaasi estää theflagellar epävakaus liittyy menetys useita axonemalstructures., PLoS Genet. 11:e10055082015. View Article : Google Scholar : PubMed/NCBI

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista. Pakolliset kentät on merkitty *