Han grundlagde Mouratoglou Tennis Academy i 1996 nær Paris (senere flyttet til udkanten af Nice, og har coachet mange up-and-coming spillere, herunder Marcos Baghdatis, som han trænes til finalen i 2006 Australian Open), Julia Vakulenko, Anastasia Pavlyuchenkova, Aravane Rezaï, Jérémy Chardy, Laura Robson, Yanina Wickmayer og Grigor Dimitrov.

Mouratoglou begyndte at coache ATP-spilleren Marcos Baghdatis i 1999, da Mouratoglou inviterede ham til sit Tennisakademi i oktober 1999 på en uges basis., Baghdatis var, ifølge Mouratoglou, “ikke en atlet på alle”, men inden for syv år ville han blive en junior verdens No. 1, vinde 2003 Australian Open drenge’ title, nå finalen i samme turnering i 2006, og nå verdens top ti.

i juli 2007 begyndte han at coache Anastasia Pavlyuchenkova. Inden for to år nåede Pavlyuchenkova verdens top 30 og har siden lavet to Grand Slam-kvartfinaler og nået en karriere-høj placering af worldorld No. 13. De sluttede deres forening i August 2009, og Mouratoglou flyttede ind på coaching både Aravane re .a and og Yanina .ickmayer., Rezaï haft et vellykket 2010 sæson, ind i verdens top 20 og vinde Premier event i Madrid, mens Wickmayer nået en karriere-høj prioritering af verden No. 12 i April 2010. Mouratoglou stoppede arbejdet med både re .a and og respectivelyickmayer i henholdsvis August 2010 og April 2012.

I December 2010, Mouratoglou startede coaching Laura Robson, der var verdens No. 217 på det tidspunkt, og stadig kæmper for at bryde ind i senior tour., De arbejdede sammen i seks måneder før adskillelse kort før .imbledon i 2011, da Robson stadig kæmpede for at gøre fremskridt på WTA Tour, efter at have glidet videre til worldorld No. 257. I samme periode coachede Mouratoglou også J .r .my Chardy inden for hans akademi.

i marts 2012 begyndte Mouratoglou coaching Grigor Dimitrov og begyndte at lede ham tilbage til verdens top 100, da han var faldet til No. 102, da han startede. Denne forening sluttede i September samme år, og Mouratoglou gik videre til sit nuværende job, udelukkende coaching Serena .illiams.,

Ved den tid, Mouratoglou startede coaching Williams, hun havde bare lidt hendes første nogensinde åbning runde nederlag i de vigtigste trække i en Grand Slam-turnering, taber i første runde af 2012 French Open. Siden da, Mouratoglou har vejledt Williams til hendes femte, sjette og syvende Wimbledon-titler, den Olympiske guldmedalje, hendes fjerde, femte, og sjette US Open-titler, hendes anden og tredje French Open-titler, tre år i træk-end mesterskaber titler, hendes sjette og syvende Australian Open titel og løftede hende tilbage til verden nummer 1 på WTA-ranglisten.,

I 2018, Stefanos Tsitsipas startede på uddannelsen i hans tennis akademier, samt at blive coachet af Patrick Mouratoglou og hans far Apostolos Tsitsipas.