Der er to hovedtyper af den humane immundefektvirus. HIV-1, som blev opdaget først, er den mest udbredte type på verdensplan. HIV-2 er mere end 55% genetisk forskellig fra HIV-1.

HIV-2 er mest almindelig i Vestafrika og bliver mere almindelig i Indien, selvom antallet der stadig er relativt små. Der er også set et lille antal tilfælde i Portugal, Frankrig, andre europæiske lande, herunder Storbritannien og Amerika, stort set hos personer med Vestafrikansk oprindelse eller deres seksuelle partnere.,

hver hovedtype af virus kan opdeles yderligere i grupper, som selv kan opdeles i clades eller undertyper. HIV-1 omfatter grupper M (main), O (outlier) og N (non-m eller O). Der er to vigtigste HIV-2-undertyper, A og B.

på grund af den genetiske forskel er HIV-1 og HIV-2-antigener forskellige nok til, at hvis en diagnostisk test kun udvikles til påvisning af HIV-1, vil den ikke pålideligt påvise HIV-2. Imidlertid er test, der er følsomme over for begge typer virus, tilgængelige., Det er vigtigt at bruge en test, der er følsom over for HIV-2, især når man tester en person, der har boet i et land, hvor HIV-2 er almindeligt eller har haft en seksuel partner fra et af disse lande. Hvis en person desuden har kliniske tegn på HIV-infektion (f.eks. tilbagevendende opportunistiske infektioner), men ikke tester positivt for en test, der kun er følsom over for HIV-1, ville det være passende at teste specifikt for HIV-2.

anti-HIV-medicin fra non nukleosid revers transkriptase inhibitor (NNRTI) klassen er ikke aktive mod HIV-2., This includes efavirenz, rilpivirine, doravirine, etravirine and nevirapine. Regimens based on an integrase inhibitor, or a protease inhibitor, are recommended.