ačkoli vrozený Hornerův syndrom může být předán v rodinách, nebyly identifikovány žádné související geny. Horner syndrom, který se zobrazí po novorozeneckém období (získané Hornerův syndrom) a nejvíce případů vrozených Horner syndrom výsledkem poškození nervů nazývá cervikální sympathetics. Tyto nervy patří do části nervového systému, která řídí nedobrovolné funkce (autonomní nervový systém). V rámci autonomního nervového systému jsou nervy součástí subdivize nazývané sympatický nervový systém., Cervikální sympatické nervy ovládají několik funkcí v oku a obličeji, jako je dilatace žáka a pocení. Problémy s funkcí těchto nervů způsobují příznaky a příznaky Hornerova syndromu. Horner syndrom, který se vyskytuje velmi brzy v životě může vést k heterochromie iris, protože vývoj pigmentace (zbarvení) duhovky je pod kontrolou krčních sympatických nervů.,

Poškození krčních sympatických nervů mohou být způsobena přímým poškozením nervů sami, což může vyplývat z trauma, které by mohly nastat při těžkém porodu, operaci, nebo úraz. Nervy související s Hornerovým syndromem mohou být také poškozeny benigním nebo rakovinovým nádorem, například dětskou rakovinou nervových tkání nazývanou neuroblastom.,

Hornerův syndrom může být také způsobena problémy s arterie, která dodává krev do hlavy a krku (krční tepny) na postižené straně, což má za následek ztrátu průtoku krve nervů. Někteří jedinci s vrozeným Hornerovým syndromem mají nedostatek vývoje (ageneze) karotidové arterie. Roztržení vrstev stěny krční tepny (disekce krční tepny) může také vést k Hornerovu syndromu.

příznaky a příznaky Hornerova syndromu se mohou objevit také během migrénové bolesti hlavy., Když je bolest hlavy pryč, příznaky a příznaky Hornerova syndromu obvykle také zmizí.

někteří lidé s Hornerovým syndromem nemají známý problém, který by vedl k poškození nervů ani k jakékoli anamnéze poruchy v jejich rodině. Tyto případy jsou označovány jako idiopatický Hornerův syndrom.